Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 MTATP6P31-201ENST00000406985 692 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 AP002345.1-201ENST00000456493 928 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 AC104689.1-201ENST00000473356 768 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 AC114284.1-201ENST00000511422 1114 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 CA3-AS1-203ENST00000524052 430 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 MTERF3-205ENST00000524341 776 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC2.29□□□□□ -2.04
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RTL8BQ17RB0 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 AL357172.1-201ENST00000556016 593 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC2.29□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 PRKCQ-AS1-207ENST00000607996 531 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 AL034549.1-201ENST00000615120 578 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 STATH-208ENST00000615994 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 KLRF1-207ENST00000617793 1096 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.28□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 C11orf40-201ENST00000307616 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 RNU4-31P-201ENST00000384211 141 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 AGR3-202ENST00000402239 563 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 AL590867.3-201ENST00000436953 438 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
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RTL8BQ17RB0 RSL24D1P2-201ENST00000445584 366 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
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RTL8BQ17RB0 PARPBP-212ENST00000543784 992 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
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RTL8BQ17RB0 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 AC006249.1-201ENST00000621223 471 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
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RTL8BQ17RB0 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
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RTL8BQ17RB0 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC2.27□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC2.27□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 AL035706.1-201ENST00000439186 683 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
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RTL8BQ17RB0 XKRYP3-201ENST00000442113 1116 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
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RTL8BQ17RB0 AADACP1-206ENST00000561502 1193 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 AP004607.9-201ENST00000618202 316 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 AL355493.4-201ENST00000618530 292 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
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RTL8BQ17RB0 NSRP1P1-201ENST00000444067 1693 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.27□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 AC009501.3-201ENST00000605001 1352 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
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