Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 SNORA5.1-201ENST00000384275 131 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 RPS4XP9-201ENST00000405151 780 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 MORF4L2-205ENST00000423833 717 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 AL591178.1-201ENST00000439239 454 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 RN7SL172P-201ENST00000460535 303 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 AC024681.2-201ENST00000523525 204 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 AL133371.2-201ENST00000556624 294 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 AC083837.1-201ENST00000565297 2994 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 MIR4675-201ENST00000577898 77 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 AC022884.2-201ENST00000578535 580 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 ZNF230-204ENST00000585632 579 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 MAPKAPK5-AS1-205ENST00000590479 543 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 AC005702.2-201ENST00000591035 481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 SUMO2P15-201ENST00000604285 278 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 AL512624.1-201ENST00000613638 469 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 RMST_9.1-201ENST00000619945 193 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 PALMD-201ENST00000263174 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 LINC02261-201ENST00000512873 2802 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 AC079915.1-201ENST00000584382 2780 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 NLRP3P1-201ENST00000622303 1785 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 THAP12P4-201ENST00000528321 2266 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 WDYHV1-208ENST00000523984 1491 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
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RTN1Q16799 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
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RTN1Q16799 AL355433.1-201ENST00000422804 300 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
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RTN1Q16799 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 AC114877.1-201ENST00000446601 582 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
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RTN1Q16799 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
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RTN1Q16799 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 AC009127.1-201ENST00000467090 155 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 RN7SL30P-201ENST00000488416 306 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 AC025164.1-201ENST00000496249 478 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
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RTN1Q16799 AC017037.1-201ENST00000508460 471 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 AP006259.1-201ENST00000528520 561 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 SLC14A2-AS1-201ENST00000585759 494 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 PSMA6P4-201ENST00000603247 718 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 DARS-AS1-225ENST00000615163 824 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 AL355480.1-201ENST00000629041 99 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 OR52H1-202ENST00000641796 1061 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
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