Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 ZRANB2-AS2-204ENST00000430605 213 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 KCTD10P1-201ENST00000434203 625 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 RPS15AP29-201ENST00000445539 400 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 AC074327.1-201ENST00000448017 540 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 AL359073.1-201ENST00000448036 403 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 HMGB1P1-201ENST00000522557 636 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 CTAGE1-202ENST00000525417 1267 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 AP002370.2-203ENST00000533101 576 ntTSL 4 BASIC2.69□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 EEF1B2P4-201ENST00000551398 348 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 TIMM9-206ENST00000555593 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 LINC01146-208ENST00000557355 548 ntTSL 4 BASIC2.69□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 LINC02345-201ENST00000557883 766 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 MTATP6P25-201ENST00000574491 261 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 AC096947.1-201ENST00000603233 470 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 AC010738.1-201ENST00000604970 987 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 AC008083.4-201ENST00000615076 444 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 AC007275.1-201ENST00000621243 671 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 AC009951.2-201ENST00000634873 644 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 SLC9B1P2-201ENST00000398120 1184 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 AL024509.3-201ENST00000413898 745 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 ELOCP3-201ENST00000439303 348 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 AC092641.1-201ENST00000440229 772 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 AC108078.3-201ENST00000502633 489 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 SUB1-203ENST00000502897 562 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.68□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 AC083923.2-202ENST00000517773 498 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 VNN2-207ENST00000525289 900 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 AC107032.2-201ENST00000551082 386 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 AL356804.1-201ENST00000553791 448 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 AL049835.1-201ENST00000555850 514 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 AC023824.3-201ENST00000569003 562 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 AC053481.3-201ENST00000577881 843 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 AC012409.2-201ENST00000619812 751 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 AC244258.1-201ENST00000637553 1071 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 AL513185.3-201ENST00000433335 1300 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 AC008432.1-201ENST00000615912 1320 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 IL36B-201ENST00000259213 1186 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 BCL2A1-202ENST00000335661 809 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 EPGN-202ENST00000413830 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 TRIM60P5Y-201ENST00000413946 574 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 VN1R42P-201ENST00000424651 344 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 AL158840.1-202ENST00000425754 694 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 AL031429.1-201ENST00000426775 749 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 SETP8-201ENST00000435341 628 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 AC068533.3-201ENST00000435524 404 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 AC091862.1-201ENST00000438016 1100 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 LINC01802-201ENST00000438824 523 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 AC005002.1-201ENST00000447458 540 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 FAIM-205ENST00000464668 641 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
TNXAQ16473 PRDX3P4-201ENST00000470828 747 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.6 ms