Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 UBE2V2P1-201ENST00000434717 398 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SCN9AQ15858 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SCN9AQ15858 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SCN9AQ15858 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SCN9AQ15858 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SCN9AQ15858 CLIC4P1-201ENST00000453177 535 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SCN9AQ15858 CFTRP1-201ENST00000456646 183 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SCN9AQ15858 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SCN9AQ15858 ACTR6P1-201ENST00000514311 1104 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SCN9AQ15858 AC027419.2-201ENST00000518439 497 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SCN9AQ15858 EEF1A1P37-201ENST00000522748 715 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SCN9AQ15858 CKS1BP1-201ENST00000555221 240 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SCN9AQ15858 LINC01578-206ENST00000555520 977 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SCN9AQ15858 AC068714.1-201ENST00000559623 800 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SCN9AQ15858 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SCN9AQ15858 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SCN9AQ15858 RPL23AP61-201ENST00000623642 466 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SCN9AQ15858 ASAH1-263ENST00000637872 886 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SCN9AQ15858 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SCN9AQ15858 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
SCN9AQ15858 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SCN9AQ15858 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SCN9AQ15858 DNAH12-201ENST00000311202 1555 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SCN9AQ15858 LINC00560-201ENST00000564593 1599 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
SCN9AQ15858 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SCN9AQ15858 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SCN9AQ15858 AC023590.1-204ENST00000434023 431 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SCN9AQ15858 CASP3P1-201ENST00000446037 609 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SCN9AQ15858 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SCN9AQ15858 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SCN9AQ15858 AC079866.2-201ENST00000541870 515 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SCN9AQ15858 PPFIA2-AS1-210ENST00000553197 875 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SCN9AQ15858 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SCN9AQ15858 AC135012.2-201ENST00000600234 479 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SCN9AQ15858 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SCN9AQ15858 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SCN9AQ15858 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SCN9AQ15858 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SCN9AQ15858 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SCN9AQ15858 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SCN9AQ15858 RPL31P53-201ENST00000457065 348 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SCN9AQ15858 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SCN9AQ15858 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SCN9AQ15858 ZNF84-212ENST00000542874 540 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SCN9AQ15858 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SCN9AQ15858 AL162591.3-201ENST00000607963 681 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SCN9AQ15858 AC116447.1-201ENST00000613153 453 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SCN9AQ15858 AC005858.1-201ENST00000620193 677 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SCN9AQ15858 AC123912.3-201ENST00000600907 1367 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SCN9AQ15858 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
SCN9AQ15858 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
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SCN9AQ15858 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SCN9AQ15858 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SCN9AQ15858 AL662791.1-201ENST00000441992 928 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SCN9AQ15858 OR6C72P-201ENST00000451403 892 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SCN9AQ15858 AL354710.1-201ENST00000453641 246 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
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SCN9AQ15858 AC011037.1-201ENST00000483964 558 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SCN9AQ15858 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
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SCN9AQ15858 GCSAML-206ENST00000527084 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
SCN9AQ15858 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
SCN9AQ15858 MRRF-203ENST00000373723 1176 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SCN9AQ15858 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SCN9AQ15858 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SCN9AQ15858 AC009502.1-203ENST00000416861 496 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
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SCN9AQ15858 RPL21P18-201ENST00000469899 480 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
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SCN9AQ15858 AP000926.3-201ENST00000497201 299 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SCN9AQ15858 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SCN9AQ15858 AC018616.1-201ENST00000524085 546 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SCN9AQ15858 AP001317.1-201ENST00000531194 960 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SCN9AQ15858 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SCN9AQ15858 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SCN9AQ15858 AC061975.8-201ENST00000587058 721 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SCN9AQ15858 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SCN9AQ15858 AL137246.1-201ENST00000607072 977 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SCN9AQ15858 CYP3A43-203ENST00000342499 1396 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
SCN9AQ15858 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SCN9AQ15858 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SCN9AQ15858 AP000233.1-201ENST00000426609 291 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SCN9AQ15858 MTCYBP29-201ENST00000436327 1006 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SCN9AQ15858 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SCN9AQ15858 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SCN9AQ15858 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
SCN9AQ15858 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SCN9AQ15858 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SCN9AQ15858 AC010406.1-201ENST00000507948 555 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SCN9AQ15858 AC104827.1-202ENST00000511917 1049 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
SCN9AQ15858 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SCN9AQ15858 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SCN9AQ15858 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SCN9AQ15858 AC090953.1-201ENST00000604305 1092 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SCN9AQ15858 AC007620.3-201ENST00000608131 497 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
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