Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 PPP1R42-201ENST00000324682 1084 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 CDKN3-203ENST00000395577 637 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 AC073508.1-201ENST00000428866 656 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 AL122010.1-201ENST00000429293 720 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 ISM1-AS1-201ENST00000431407 652 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 MTCYBP14-201ENST00000457471 715 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 OR5AK3P-201ENST00000527486 1297 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 MTND2P26-201ENST00000528255 1029 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 AC092112.1-201ENST00000538329 640 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 PCNAP1-202ENST00000595299 752 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 AC084036.1-201ENST00000609190 508 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 AP004607.9-201ENST00000618202 316 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 AC006963.1-201ENST00000624003 1052 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 AC011124.1-201ENST00000521221 1762 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 CSN3-201ENST00000304954 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 SIRPD-201ENST00000381621 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 RN7SKP263-201ENST00000411194 309 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 LINC02529-201ENST00000429657 772 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 GNGT1-204ENST00000430875 628 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 LINC01378-202ENST00000437514 783 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 CDC27P1-201ENST00000445384 715 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 OR6C72P-201ENST00000451403 892 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 AC096992.1-201ENST00000459808 709 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 AC092593.2-201ENST00000513866 913 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 AC093535.1-201ENST00000515808 747 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 RNU6-319P-201ENST00000516025 108 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 IGKV2D-10-201ENST00000520194 281 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 AL590385.2-201ENST00000537821 553 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 AC009509.2-201ENST00000538640 429 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 LINC02301-201ENST00000553760 773 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 AC090618.1-201ENST00000571972 585 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 AP005120.1-202ENST00000584321 506 ntTSL 4 BASIC2.26□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 OR6C76-201ENST00000328314 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 TRAJ35-201ENST00000390502 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 NUP35P2-201ENST00000416748 943 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 RPL31P20-201ENST00000449593 360 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 GTF2IP9-201ENST00000502460 301 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 AL133304.2-201ENST00000546376 886 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 AF230666.2-201ENST00000602328 725 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 OR5R1-201ENST00000623286 975 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 RNU6-1251P-201ENST00000364502 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
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