Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RYR3Q15413 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RYR3Q15413 RPS7P2-201ENST00000435134 607 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RYR3Q15413 AC093422.2-201ENST00000452599 686 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
RYR3Q15413 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
RYR3Q15413 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
RYR3Q15413 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RYR3Q15413 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RYR3Q15413 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
RYR3Q15413 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RYR3Q15413 RNA5SP146-201ENST00000410743 123 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RYR3Q15413 AC016903.1-201ENST00000444017 588 ntTSL 4 BASIC1.63□□□□□ -2.15
RYR3Q15413 LNCPRESS2-201ENST00000502518 616 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
RYR3Q15413 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RYR3Q15413 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RYR3Q15413 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RYR3Q15413 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
RYR3Q15413 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
RYR3Q15413 MEIOB-205ENST00000470044 1857 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
RYR3Q15413 IQCA1-AS1-201ENST00000413353 489 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
RYR3Q15413 MTND2P11-201ENST00000423638 648 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RYR3Q15413 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RYR3Q15413 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
RYR3Q15413 AC007610.2-201ENST00000566770 666 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
RYR3Q15413 AL451074.6-201ENST00000608512 729 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RYR3Q15413 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
RYR3Q15413 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
RYR3Q15413 MTND4P26-201ENST00000415971 1359 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RYR3Q15413 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RYR3Q15413 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RYR3Q15413 TRIM60P13-201ENST00000432350 1283 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RYR3Q15413 SPINK9-202ENST00000511717 604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
RYR3Q15413 AL354821.1-201ENST00000617598 809 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
RYR3Q15413 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
RYR3Q15413 PCF11-AS1-201ENST00000602322 1516 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RYR3Q15413 AC000367.1-201ENST00000452711 1766 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RYR3Q15413 MTND2P25-201ENST00000449028 610 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RYR3Q15413 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RYR3Q15413 SETP4-201ENST00000455717 868 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RYR3Q15413 AC010307.1-201ENST00000467206 836 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RYR3Q15413 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RYR3Q15413 AL024509.2-201ENST00000493462 493 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RYR3Q15413 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
RYR3Q15413 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
RYR3Q15413 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
RYR3Q15413 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
RYR3Q15413 GABPB1-204ENST00000396464 1401 ntTSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
RYR3Q15413 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
RYR3Q15413 NCAPGP1-201ENST00000505112 1814 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RYR3Q15413 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RYR3Q15413 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RYR3Q15413 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
RYR3Q15413 MTND3P6-201ENST00000485242 339 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RYR3Q15413 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RYR3Q15413 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RYR3Q15413 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RYR3Q15413 ZEB2-227ENST00000627532 9541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
RYR3Q15413 AC087565.3-202ENST00000642085 1603 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RYR3Q15413 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
RYR3Q15413 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
RYR3Q15413 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
RYR3Q15413 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
RYR3Q15413 KLRC2-201ENST00000381901 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
RYR3Q15413 KRTAP27-1-201ENST00000382835 682 ntAPPRIS P1 BASIC1.62□□□□□ -2.15
RYR3Q15413 AL138878.1-201ENST00000405131 347 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RYR3Q15413 RNA5SP104-201ENST00000410989 118 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RYR3Q15413 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RYR3Q15413 MED6P1-201ENST00000439659 713 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RYR3Q15413 AC121761.2-201ENST00000617300 689 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RYR3Q15413 KLRC2-206ENST00000619500 883 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
RYR3Q15413 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
RYR3Q15413 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
RYR3Q15413 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RYR3Q15413 AL365396.1-201ENST00000430854 671 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RYR3Q15413 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
RYR3Q15413 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
RYR3Q15413 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC1.62□□□□□ -2.15
RYR3Q15413 MEI4-201ENST00000602452 4800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
RYR3Q15413 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
RYR3Q15413 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RYR3Q15413 SNORD74.4-201ENST00000364129 80 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RYR3Q15413 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RYR3Q15413 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC1.62□□□□□ -2.15
RYR3Q15413 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RYR3Q15413 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
RYR3Q15413 AC079296.1-202ENST00000521394 960 ntTSL 4 BASIC1.62□□□□□ -2.15
RYR3Q15413 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RYR3Q15413 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
RYR3Q15413 VNN2-201ENST00000326499 2118 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
RYR3Q15413 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RYR3Q15413 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RYR3Q15413 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
RYR3Q15413 RPS24P8-201ENST00000431490 402 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RYR3Q15413 SETSIP-201ENST00000485873 879 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
RYR3Q15413 OR1S1-201ENST00000624470 978 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RYR3Q15413 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
RYR3Q15413 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RYR3Q15413 ABCC9-201ENST00000261200 8293 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
RYR3Q15413 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
RYR3Q15413 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.3 ms