Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 AL022097.1-201ENST00000602500 806 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC6□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 TP53TG1_2.1-201ENST00000611226 182 ntBASIC6□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 MRPL57P3-201ENST00000619218 176 ntBASIC6□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 RUFY3-202ENST00000381006 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 SSH1-202ENST00000326495 13040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 MECOM-209ENST00000472280 3593 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 AC092079.1-201ENST00000558620 1985 ntBASIC6□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 ZFY-207ENST00000625061 2273 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 PUM1-207ENST00000440538 3936 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 AC105235.1-201ENST00000623208 1816 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 LINC00630-201ENST00000416381 2012 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 HECW2-201ENST00000260983 11809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 SH2D1B-201ENST00000367929 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 IFI16-203ENST00000359709 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 FMN1-212ENST00000616417 13529 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 AC089998.1-201ENST00000548575 3141 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 CCDC129-211ENST00000615280 4142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 C16orf62-204ENST00000448695 3353 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 C16orf62-216ENST00000543152 3352 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 PLCE1-201ENST00000371375 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 SLC12A6-218ENST00000560611 4239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 PMFBP1-207ENST00000537465 3935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 LINC02384-201ENST00000360485 471 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 CTSL3P-202ENST00000412179 788 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 AC010881.1-201ENST00000433830 235 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 AL096678.1-201ENST00000438877 472 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 AC108488.1-202ENST00000439547 482 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 AC091180.1-201ENST00000462104 372 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 AC006499.6-201ENST00000511169 607 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 AC091180.4-201ENST00000511322 245 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 IGKV2D-38-201ENST00000518423 240 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 OR10G5P-201ENST00000532733 358 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 C14orf2-211ENST00000557040 472 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 FAM106CP-201ENST00000582212 507 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 SS18L2P2-201ENST00000583960 235 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 AC098847.2-201ENST00000588088 528 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 AL669942.1-206ENST00000610473 783 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 AL121985.3-201ENST00000620690 523 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 IL21-AS1-201ENST00000417927 3748 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 FAM216B-202ENST00000537894 3300 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 TTC21B-201ENST00000243344 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 THRB-203ENST00000396671 7506 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 HSPA8P18-201ENST00000439846 1928 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 PIGN-239ENST00000639902 4439 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 RIMS1-219ENST00000523963 3097 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 CAPRIN2-202ENST00000395805 4156 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 PDE4D-226ENST00000546160 7690 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 POC1B-201ENST00000313546 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 SDAD1-201ENST00000356260 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 MAPK10-287ENST00000641217 3037 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 FAM161A-202ENST00000404929 3762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 UGT2B11-201ENST00000446444 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 BABAM2-206ENST00000379632 1752 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 NFIB-211ENST00000606230 2311 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 NCOA7-201ENST00000229634 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 MEIOC-202ENST00000409464 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 NBPF12-205ENST00000617614 4630 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 PSG1-206ENST00000595356 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 RNA5SP152-201ENST00000365184 110 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 MIR187-201ENST00000385062 109 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 PUDPP2-201ENST00000431423 643 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 LINC00280-201ENST00000439525 448 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 UBBP5-201ENST00000446970 266 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 AC010891.1-201ENST00000449963 448 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 AC006026.3-201ENST00000454029 143 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 TFP1-201ENST00000460564 572 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 RN7SL849P-201ENST00000485236 295 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 AC020890.1-201ENST00000491837 504 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 MFAP3L-206ENST00000506110 548 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 RN7SKP283-201ENST00000517197 270 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 AC142086.4-201ENST00000568904 650 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 AC004034.1-201ENST00000573260 510 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.4 ms