Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 AC136777.2-201ENST00000522979 358 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 LINC00706-201ENST00000628989 699 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 CYLD-203ENST00000427738 8503 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 DOCK9-208ENST00000448493 7887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 SBNO1-202ENST00000420886 10981 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 EPS8-207ENST00000540613 2204 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 SOCS5P3-201ENST00000425115 1576 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 VNN2-201ENST00000326499 2118 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 OR10A3-202ENST00000642047 2650 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 NRCAM-210ENST00000425651 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 GHR-210ENST00000615111 4814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 MDM4-203ENST00000367182 10073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 ANKRD17-203ENST00000509867 8105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 TEDDM1-201ENST00000367565 2500 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 WDR89-201ENST00000267522 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 OR5AS1-201ENST00000313555 975 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 AL591135.1-201ENST00000401578 5914 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 GSTM3P2-201ENST00000412746 530 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 GPC6-AS1-201ENST00000436329 698 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 RPL7P28-201ENST00000437739 740 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 AL356289.2-201ENST00000455238 292 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 AL353152.1-201ENST00000455973 470 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 RN7SL738P-201ENST00000470264 297 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 IGLV2-34-201ENST00000490007 283 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 AC008780.1-201ENST00000513392 409 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 EIF3KP3-201ENST00000514461 639 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 SDCBP-207ENST00000520168 1097 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 AL137058.3-201ENST00000624531 3099 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 NSD3-206ENST00000527502 4471 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 CRISP1-202ENST00000335847 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 RNF150-202ENST00000420921 3673 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 AC097504.1-201ENST00000515103 2415 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 C2orf16-201ENST00000408964 6200 ntAPPRIS P2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 NBPF26-202ENST00000611287 2701 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 NBPF14-211ENST00000621070 2701 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 NAV1-201ENST00000367295 11645 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 OR52E6-202ENST00000379946 954 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 AL591848.1-201ENST00000413092 322 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 AL138831.1-201ENST00000415144 209 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 CHIAP3-201ENST00000423668 1133 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 AC010157.1-201ENST00000440589 527 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 AC005008.1-201ENST00000456151 612 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 AC138965.1-202ENST00000502354 547 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 AC140125.3-201ENST00000505248 547 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
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