Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 AL359265.2-201ENST00000434367 631 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
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COL9A2Q14055 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 AC003991.1-205ENST00000447758 625 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
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COL9A2Q14055 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
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COL9A2Q14055 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
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COL9A2Q14055 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 KIAA0586-214ENST00000619416 8233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
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COL9A2Q14055 CDH10-201ENST00000264463 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
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COL9A2Q14055 DCC-202ENST00000412726 9525 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 GABRA1-220ENST00000638159 4088 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
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