Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 AC007899.1-201ENST00000412776 775 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 AC093698.1-201ENST00000423843 571 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 LINC01445-201ENST00000426205 812 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 AL031736.2-201ENST00000426573 787 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 HMGB1P45-201ENST00000435986 653 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 AL353748.1-201ENST00000440753 474 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 YWHAQP9-201ENST00000445891 512 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 RPL21P71-201ENST00000465598 459 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 AC107463.1-203ENST00000509713 284 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 RN7SKP283-201ENST00000517197 270 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 COX6B1P6-201ENST00000522347 255 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 OR4A12P-201ENST00000530847 918 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 MRPL42-208ENST00000552217 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 AC011824.2-203ENST00000579975 633 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 AC008507.1-201ENST00000587506 734 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 OR4G1P-201ENST00000588632 938 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 AC067852.4-201ENST00000590314 478 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 MIR7515HG-239ENST00000591053 1113 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 AC099669.2-201ENST00000616549 437 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 CDRT1-208ENST00000630868 794 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 AC087821.2-201ENST00000637086 450 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 LPAR4-201ENST00000435339 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 ARHGAP28-207ENST00000532996 1859 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 MS4A14-203ENST00000395005 2813 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 OR6C2-203ENST00000641516 1682 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 POU2F1-204ENST00000367866 13905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 NR3C1-202ENST00000343796 7286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 MAPK10-253ENST00000641010 4072 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 RNU6-1339P-201ENST00000363574 91 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 AC108681.1-202ENST00000417384 589 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 RPL17P36-201ENST00000420302 549 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 AL672277.1-201ENST00000420865 588 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 GTF2IP23-201ENST00000423746 351 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 TRIM60P3Y-201ENST00000432201 673 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 AC234064.1-201ENST00000436312 247 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 AC009263.1-201ENST00000441193 1239 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 AC096558.1-202ENST00000442794 561 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 AC026355.2-201ENST00000456755 723 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 SUB1-203ENST00000502897 562 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 RNU6-678P-201ENST00000516832 109 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 LINC00534-201ENST00000517400 793 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 AC099676.1-201ENST00000608886 657 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 AC025594.3-201ENST00000613068 790 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 KRTAP27-1-201ENST00000382835 682 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 MIR93-201ENST00000385024 80 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 TRAJ7-201ENST00000390530 59 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 AC114814.2-201ENST00000419195 485 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 RPL7P44-201ENST00000424827 742 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 AL357833.2-201ENST00000426811 430 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 OR4F13P-201ENST00000428478 931 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 NPM1P34-201ENST00000428821 893 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.1 ms