Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL4AQ13619 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL4AQ13619 AL096678.1-201ENST00000438877 472 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL4AQ13619 AL157359.2-201ENST00000440372 784 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL4AQ13619 AC012070.1-201ENST00000442062 427 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL4AQ13619 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL4AQ13619 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL4AQ13619 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL4AQ13619 AC023598.1-201ENST00000472521 361 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL4AQ13619 MTCO3P35-201ENST00000485582 781 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL4AQ13619 AC092045.1-201ENST00000495716 1231 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL4AQ13619 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL4AQ13619 MTCYBP17-201ENST00000503579 789 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL4AQ13619 AC010273.1-201ENST00000504129 946 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL4AQ13619 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL4AQ13619 AC020593.1-201ENST00000507399 299 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL4AQ13619 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL4AQ13619 AC116353.3-201ENST00000511215 249 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL4AQ13619 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL4AQ13619 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL4AQ13619 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL4AQ13619 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL4AQ13619 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL4AQ13619 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL4AQ13619 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL4AQ13619 MIR4644-201ENST00000579929 84 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL4AQ13619 AC006116.9-201ENST00000591630 649 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL4AQ13619 BNIP3P11-201ENST00000603878 563 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL4AQ13619 AL450336.1-201ENST00000605180 586 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL4AQ13619 AC055876.5-201ENST00000605667 259 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL4AQ13619 AC011816.2-201ENST00000607089 556 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL4AQ13619 AC080013.4-201ENST00000607624 649 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL4AQ13619 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL4AQ13619 uc_338.32-201ENST00000615087 172 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL4AQ13619 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL4AQ13619 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL4AQ13619 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL4AQ13619 MIR4278-201ENST00000636094 69 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL4AQ13619 AC119674.1-207ENST00000641355 633 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL4AQ13619 DNAJC10-201ENST00000264065 20129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL4AQ13619 PREPL-207ENST00000409957 4703 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL4AQ13619 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL4AQ13619 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL4AQ13619 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL4AQ13619 CACNB4-260ENST00000637762 3800 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL4AQ13619 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL4AQ13619 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL4AQ13619 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL4AQ13619 STXBP4-201ENST00000376352 15590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL4AQ13619 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL4AQ13619 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL4AQ13619 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL4AQ13619 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL4AQ13619 AL592310.1-201ENST00000414330 671 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL4AQ13619 RPL31P12-201ENST00000422587 358 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL4AQ13619 AL390774.2-201ENST00000423942 788 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL4AQ13619 NIPA2P1-201ENST00000426223 976 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL4AQ13619 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL4AQ13619 AL513412.1-201ENST00000445708 553 ntTSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL4AQ13619 AC034228.3-201ENST00000446275 562 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL4AQ13619 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL4AQ13619 AC010890.1-201ENST00000454699 469 ntTSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL4AQ13619 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL4AQ13619 RPL7P38-201ENST00000488396 739 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL4AQ13619 MSMO1-203ENST00000504317 1026 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL4AQ13619 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL4AQ13619 AC093752.2-201ENST00000506942 573 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL4AQ13619 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL4AQ13619 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL4AQ13619 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL4AQ13619 MED28P5-201ENST00000528254 438 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL4AQ13619 RAP1B-224ENST00000541216 701 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL4AQ13619 AC004987.4-201ENST00000603383 338 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL4AQ13619 AC010738.1-201ENST00000604970 987 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL4AQ13619 MIR6748-201ENST00000610433 71 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL4AQ13619 AC138393.3-201ENST00000618397 573 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL4AQ13619 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL4AQ13619 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL4AQ13619 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL4AQ13619 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL4AQ13619 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL4AQ13619 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL4AQ13619 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL4AQ13619 AL390862.1-201ENST00000635467 1469 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL4AQ13619 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL4AQ13619 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL4AQ13619 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL4AQ13619 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL4AQ13619 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL4AQ13619 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL4AQ13619 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL4AQ13619 KLRC3-201ENST00000381903 798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL4AQ13619 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL4AQ13619 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL4AQ13619 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL4AQ13619 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL4AQ13619 AC091493.1-201ENST00000426218 411 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL4AQ13619 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL4AQ13619 RSL24D1P6-201ENST00000426934 401 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL4AQ13619 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
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