Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 LINC02240-201ENST00000564199 1336 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 U6.112-201ENST00000384129 70 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 SNORD116-8-201ENST00000384365 95 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 RNU6-1151P-201ENST00000384684 107 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 RN7SKP285-201ENST00000410137 318 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 RN7SKP53-201ENST00000411337 315 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 AC006007.1-201ENST00000422084 672 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 AC074327.1-201ENST00000448017 540 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 AL158210.1-201ENST00000448835 500 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 AL512658.1-201ENST00000449072 533 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 RNU7-140P-201ENST00000459546 60 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 AC004263.1-201ENST00000479327 332 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 SEMA6A-AS2-201ENST00000508766 482 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 ARL2BPP6-201ENST00000512757 439 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 AC118465.1-201ENST00000513820 1271 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 ZFPM2-AS1-207ENST00000524045 987 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 AC107882.1-201ENST00000530837 477 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 AC068875.1-201ENST00000561054 463 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 AC023813.2-201ENST00000564321 469 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 AC006116.9-201ENST00000591630 649 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 AC008687.2-201ENST00000597865 520 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 AC022145.1-201ENST00000600673 383 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 AC013468.1-201ENST00000608680 598 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 AL512506.2-201ENST00000624472 458 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 PSG6-202ENST00000292125 1391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 MTND5P31-201ENST00000419366 1374 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 IL21-201ENST00000264497 629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 GLIPR1L1-201ENST00000312442 1132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 AC009237.5-201ENST00000414271 501 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 AL356320.2-201ENST00000417263 507 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 SLC16A12-AS1-201ENST00000423474 405 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 AC005165.1-203ENST00000423689 1281 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 AP000695.2-201ENST00000428667 715 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 MTND5P25-201ENST00000430499 799 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 LINC00411-201ENST00000436722 461 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 THAP5P1-201ENST00000439089 262 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 GACAT1-202ENST00000441383 540 ntTSL 4 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 AC112492.1-201ENST00000449607 712 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 RPL23AP15-201ENST00000450202 459 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 TPTE2P6-203ENST00000450973 649 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 OFD1P7Y-201ENST00000454643 1155 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 ACTG1P13-201ENST00000486987 1043 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 LINC02198-201ENST00000504280 810 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 WBP1LP4-201ENST00000505043 344 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 AC108467.1-201ENST00000515623 672 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 RNU6-1028P-201ENST00000517164 93 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 AC134043.1-201ENST00000521204 638 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 AP001999.2-201ENST00000529417 389 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 AL354920.1-202ENST00000531661 1017 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 TIMM9-206ENST00000555593 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 LINC01491-202ENST00000558792 439 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 AC012170.3-201ENST00000560159 297 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 Z94722.1-201ENST00000604328 474 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 AC025588.2-201ENST00000604851 466 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 ADPRM-204ENST00000609540 1138 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 AC123767.1-202ENST00000620407 817 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 AC244472.1-201ENST00000620773 347 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.9 ms