Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 OTC-201ENST00000039007 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 SYCP2L-207ENST00000543878 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 USP9YP4-201ENST00000424401 1745 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 ZNF682-207ENST00000595736 1710 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 NAP1L4P1-201ENST00000319092 1157 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 C21orf91-OT1-202ENST00000430815 717 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 RPL12P46-201ENST00000436610 195 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 DARS-AS1-206ENST00000446492 488 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 GAPDHP14-201ENST00000450472 937 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 AP001439.1-201ENST00000455275 392 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 AC083800.1-201ENST00000490594 246 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 AF186190.1-201ENST00000517470 480 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 AP002340.1-201ENST00000529298 285 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 AC006518.2-202ENST00000544947 297 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 AL360267.1-201ENST00000607309 666 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 AC010424.2-201ENST00000607594 443 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 SPINK5-202ENST00000359874 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 AC002525.1-201ENST00000624392 1622 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 GHR-210ENST00000615111 4814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 ZNF568-216ENST00000619231 3797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 AC007390.2-201ENST00000606229 3803 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 ZNF808-201ENST00000359798 3600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 AL122126.1-201ENST00000546905 1318 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 RABGAP1L-202ENST00000325589 1880 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 Z95327.2-201ENST00000414579 1873 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 CD80-204ENST00000478182 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 AC019155.1-201ENST00000382242 574 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 AC106873.1-201ENST00000420664 459 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 AL672277.1-201ENST00000420865 588 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 TRAPPC2P5-201ENST00000426293 308 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 OR4F13P-201ENST00000428478 931 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 RPS3AP54-201ENST00000435535 734 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 MAP3K13-207ENST00000438798 388 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 AL162419.1-201ENST00000440674 873 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 TDGF1P1-201ENST00000445734 527 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 EEF1A1P1-201ENST00000447052 739 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 RPL23AP24-201ENST00000458203 385 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 RPS27AP17-201ENST00000463344 455 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 AC021660.1-201ENST00000465006 554 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 AC098587.1-201ENST00000508241 540 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 AC068672.1-201ENST00000520391 328 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 AC136777.2-201ENST00000522979 358 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 ARL6IP1P1-201ENST00000545836 610 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 NDUFB4P11-201ENST00000560510 395 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 AC090617.5-201ENST00000571815 528 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 RN7SL802P-201ENST00000577858 299 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
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