Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 SNORA11.5-201ENST00000408163 128 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 AC073257.2-201ENST00000413991 528 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 SRGAP3-AS1-201ENST00000414633 428 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 AL592293.2-201ENST00000422292 996 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 Z82198.2-201ENST00000434741 567 ntTSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 AL354794.1-201ENST00000442103 516 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 RNF219-AS1-202ENST00000444769 590 ntTSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 AC078785.3-201ENST00000476607 425 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 AC027613.1-201ENST00000508414 457 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 SSX6-203ENST00000509958 336 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 TMEM248P1-201ENST00000510579 951 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 AC021146.3-201ENST00000511911 260 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 LINC02112-202ENST00000512976 464 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 AC040914.1-201ENST00000518674 318 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 AC024224.1-201ENST00000538284 609 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 LINC02400-201ENST00000548210 351 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 TEX49-202ENST00000548380 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 SMARCE1P3-201ENST00000553649 1231 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 AP005059.1-201ENST00000578391 456 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 SNORD95-201ENST00000579879 68 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 MIR3614-201ENST00000581261 86 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 AL360267.1-201ENST00000607309 666 ntTSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 AC092747.4-201ENST00000620519 1861 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 ADGRL2-203ENST00000370713 5382 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 NKIRAS1-209ENST00000614374 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 ACKR4-201ENST00000249887 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 FAM111A-201ENST00000361723 3592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 CCDC178-202ENST00000383096 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 CLPS-201ENST00000259938 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
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TOP3AQ13472 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 SNORA17A-201ENST00000391185 133 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 AL136116.1-201ENST00000403591 381 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
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TOP3AQ13472 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 AC092832.1-201ENST00000422934 400 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 EIF4HP2-201ENST00000424380 563 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 AC018644.1-201ENST00000429934 551 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 HMGB3P9-201ENST00000441799 583 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
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TOP3AQ13472 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
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TOP3AQ13472 AC024132.2-201ENST00000506878 482 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
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TOP3AQ13472 RNA5SP362-201ENST00000516048 118 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
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TOP3AQ13472 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
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TOP3AQ13472 IGHVIII-67-4-201ENST00000524281 296 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
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TOP3AQ13472 AC087477.3-201ENST00000559214 552 ntTSL 4 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
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TOP3AQ13472 Z98949.1-212ENST00000609820 837 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
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TOP3AQ13472 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 uc_338.18-201ENST00000615451 175 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 CLPS-202ENST00000616014 436 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
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