Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 TTTY2B-201ENST00000450591 3168 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 ZMYND11-204ENST00000381604 4066 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 ZNF3-203ENST00000303915 3473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 LCP1-201ENST00000323076 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 MYO6-202ENST00000369977 5597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 ALG13-224ENST00000610588 4175 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 GMFG-201ENST00000253054 616 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 ALDH7A1P4-201ENST00000412255 178 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 RPS12P23-201ENST00000419579 400 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 CYP4F32P-201ENST00000426492 504 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 AL021937.3-201ENST00000446543 361 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 SENP1-201ENST00000448372 4679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 AL450023.1-201ENST00000450868 751 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 BX323845.2-201ENST00000458382 234 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 RN7SL83P-201ENST00000468131 297 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 RN7SL189P-201ENST00000468631 289 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 AC008957.1-203ENST00000508745 589 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 APOBEC3AP1-201ENST00000511396 287 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 WBP2NL-210ENST00000543212 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 AC090181.1-201ENST00000560446 264 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 AC022968.1-201ENST00000567372 442 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 GMFG-202ENST00000594700 397 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 CDC42EP3P1-201ENST00000601004 764 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 GMFG-212ENST00000602185 423 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 LY86-AS1-206ENST00000607278 677 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 AC244517.6-202ENST00000623884 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.83□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 BPIFC-203ENST00000397452 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 NRXN3-203ENST00000428277 4219 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 PLD5-203ENST00000427495 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 KAT6B-202ENST00000372711 7560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 ATM-201ENST00000278616 13147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 RBM25-201ENST00000261973 6910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 UTP6-201ENST00000261708 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 CLEC2D-203ENST00000290855 5279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 PRUNE2-201ENST00000223609 2697 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 AC023245.2-201ENST00000530760 2978 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 RN7SKP191-201ENST00000364713 306 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 SNORD94-201ENST00000386037 137 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 AC128677.1-201ENST00000436016 442 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 LINC00570-203ENST00000437795 490 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 AC018638.3-201ENST00000461273 132 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 RN7SL502P-201ENST00000481857 290 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 AC108727.2-201ENST00000512277 392 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 RNA5SP473-201ENST00000516402 125 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC7.82□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 AC123786.2-201ENST00000603459 275 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 AC109309.2-201ENST00000612597 332 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 Metazoa_SRP.77-201ENST00000616915 252 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 DOCK5-201ENST00000276440 10075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 SLC7A6-209ENST00000566454 6308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 RAI14-228ENST00000515799 3486 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 NXF2B-205ENST00000618881 3193 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 NUP43-201ENST00000340413 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 ENTPD1-205ENST00000453258 5044 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 A2M-201ENST00000318602 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 STARD4-AS1-201ENST00000500779 5525 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 ZNF761-202ENST00000432094 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 BEST3-212ENST00000553096 2929 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 SYTL2-220ENST00000529581 1910 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 KIF1B-203ENST00000377083 5885 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 SORBS1-203ENST00000354106 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 CR1-203ENST00000367051 7469 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 CR1-204ENST00000367052 7469 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 CR1-205ENST00000367053 7469 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 PGAP1-201ENST00000354764 11114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 KLHL7-203ENST00000409689 3231 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 TTTY15-202ENST00000440408 5284 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 REV3L-203ENST00000368805 10461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 ATR-201ENST00000350721 8249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 AL359263.1-201ENST00000441188 2796 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 PDE4DIP-205ENST00000369354 8262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 LALBA-201ENST00000301046 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 AP000812.1-201ENST00000378140 477 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 KRTAP3-4P-201ENST00000430780 280 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.8 ms