Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 RN7SL176P-201ENST00000580352 264 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
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SP140Q13342 MIR4737-201ENST00000583979 81 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SP140Q13342 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AP002360.3-201ENST00000607673 710 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AC133644.2-201ENST00000608142 540 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
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SP140Q13342 CPB2-202ENST00000439329 1655 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SP140Q13342 NAP1L1-204ENST00000535020 1686 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SP140Q13342 NABP1-205ENST00000425611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SP140Q13342 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SP140Q13342 SCEL-201ENST00000349847 2386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SP140Q13342 DCDC1-211ENST00000597505 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
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SP140Q13342 CD80-201ENST00000264246 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
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SP140Q13342 LINC01289-201ENST00000519550 3712 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
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SP140Q13342 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SP140Q13342 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
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SP140Q13342 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
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SP140Q13342 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
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SP140Q13342 FOXP2-220ENST00000634411 4065 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SP140Q13342 ACTR3BP2-202ENST00000623630 1338 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SP140Q13342 AC008033.1-201ENST00000216407 1162 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SP140Q13342 OR5AS1-201ENST00000313555 975 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SP140Q13342 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SP140Q13342 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SP140Q13342 RN7SKP115-201ENST00000363177 317 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SP140Q13342 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SP140Q13342 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SP140Q13342 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
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