Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
ATMQ13315 OR5K3-201ENST00000383695 966 ntAPPRIS P1 BASIC2.04□□□□□ -2.08
ATMQ13315 AL355379.1-201ENST00000405542 640 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ATMQ13315 RHEBP3-201ENST00000411920 351 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ATMQ13315 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ATMQ13315 AC024022.1-202ENST00000508911 394 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
ATMQ13315 MIR2114-201ENST00000516645 80 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ATMQ13315 AL137129.1-201ENST00000555937 720 ntTSL 4 BASIC2.04□□□□□ -2.08
ATMQ13315 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ATMQ13315 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
ATMQ13315 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
ATMQ13315 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ATMQ13315 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
ATMQ13315 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ATMQ13315 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
ATMQ13315 ARHGAP28-207ENST00000532996 1859 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
ATMQ13315 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
ATMQ13315 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
ATMQ13315 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ATMQ13315 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ATMQ13315 ASNSP4-201ENST00000511103 447 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ATMQ13315 AC119751.1-201ENST00000513357 765 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ATMQ13315 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ATMQ13315 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ATMQ13315 AC007610.2-201ENST00000566770 666 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
ATMQ13315 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
ATMQ13315 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
ATMQ13315 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
ATMQ13315 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
ATMQ13315 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
ATMQ13315 LINC00560-201ENST00000564593 1599 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
ATMQ13315 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
ATMQ13315 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
ATMQ13315 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
ATMQ13315 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ATMQ13315 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ATMQ13315 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ATMQ13315 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ATMQ13315 RPS12P5-201ENST00000423449 371 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ATMQ13315 MTCO2P17-201ENST00000424336 677 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ATMQ13315 AC073359.1-201ENST00000486545 521 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
ATMQ13315 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ATMQ13315 AL451137.1-201ENST00000523363 443 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
ATMQ13315 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
ATMQ13315 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
ATMQ13315 AC008505.1-203ENST00000637345 1766 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
ATMQ13315 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
ATMQ13315 AC107027.3-201ENST00000565095 3473 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ATMQ13315 OR5B12-202ENST00000641921 1807 ntAPPRIS P1 BASIC2.03□□□□□ -2.08
ATMQ13315 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ATMQ13315 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ATMQ13315 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ATMQ13315 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ATMQ13315 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
ATMQ13315 AC011037.1-201ENST00000483964 558 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ATMQ13315 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
ATMQ13315 AC004825.2-201ENST00000616634 455 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ATMQ13315 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
ATMQ13315 FKTN-201ENST00000223528 7364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
ATMQ13315 RPS20P25-201ENST00000412447 352 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ATMQ13315 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
ATMQ13315 GACAT1-202ENST00000441383 540 ntTSL 4 BASIC2.02□□□□□ -2.09
ATMQ13315 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
ATMQ13315 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.02□□□□□ -2.09
ATMQ13315 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ATMQ13315 MFSD8-245ENST00000641743 948 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ATMQ13315 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
ATMQ13315 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
ATMQ13315 AL450263.2-201ENST00000439400 589 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ATMQ13315 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ATMQ13315 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ATMQ13315 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
ATMQ13315 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
ATMQ13315 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
ATMQ13315 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ATMQ13315 AC090229.1-201ENST00000590983 1609 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ATMQ13315 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
ATMQ13315 MIR137-201ENST00000385223 102 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ATMQ13315 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC2.02□□□□□ -2.09
ATMQ13315 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ATMQ13315 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ATMQ13315 FGF7P3-201ENST00000454645 303 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ATMQ13315 AC106872.2-201ENST00000494303 480 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ATMQ13315 AC104090.1-201ENST00000506341 1171 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ATMQ13315 AC122134.1-201ENST00000565664 1104 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ATMQ13315 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
ATMQ13315 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
ATMQ13315 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ATMQ13315 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ATMQ13315 MTATP6P11-201ENST00000428071 670 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ATMQ13315 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
ATMQ13315 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
ATMQ13315 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ATMQ13315 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ATMQ13315 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
ATMQ13315 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ATMQ13315 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
ATMQ13315 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ATMQ13315 LINC00317-201ENST00000419069 612 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
ATMQ13315 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
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