Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 AC016705.1-201ENST00000548231 1891 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 FER-202ENST00000438717 1531 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 RNU1-85P-201ENST00000364127 164 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 AL356967.1-201ENST00000406305 431 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 RPL31P52-201ENST00000407532 367 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 AC006369.1-201ENST00000419425 548 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 UQCRBP1-201ENST00000421129 336 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 AL590666.1-201ENST00000428641 433 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 AL133260.2-201ENST00000445833 396 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 LINC01729-201ENST00000450640 358 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 AL359715.2-201ENST00000452402 682 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 FO393408.1-201ENST00000458577 582 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 AC078785.3-201ENST00000476607 425 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 AL365356.5-201ENST00000478294 697 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 RAD51AP1P1-201ENST00000484195 1001 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 RN7SL441P-201ENST00000492388 296 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 PAIP2-205ENST00000510080 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 HIGD1AP5-201ENST00000529959 259 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 AC091231.1-201ENST00000558443 391 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 AC009562.1-202ENST00000558755 565 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 NDUFB4P11-201ENST00000560510 395 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 CHEK2P2-203ENST00000566448 670 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 TVP23CP2-201ENST00000571473 623 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 AP005059.1-201ENST00000578391 456 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 RN7SL52P-201ENST00000584271 284 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 AL662844.3-201ENST00000606909 517 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 AC103710.3-201ENST00000608157 948 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 NAA60-237ENST00000615865 326 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 RN7SL722P-201ENST00000617780 284 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 RN7SL565P-201ENST00000618246 284 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 GOLT1B-210ENST00000631252 223 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 AC005005.4-201ENST00000623789 16698 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 AC097504.1-201ENST00000515103 2415 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 CFHR3-205ENST00000471440 1965 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 PDCD1LG2-201ENST00000397747 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 AC105074.1-201ENST00000623380 3095 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 AL590139.1-201ENST00000416267 400 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 AL450023.3-201ENST00000440592 271 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 RPL10P17-201ENST00000453852 316 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 RPL23AP56-201ENST00000460778 453 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 APOOP2-201ENST00000461561 539 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 RN7SL738P-201ENST00000470264 297 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 SLC9A9-AS1-201ENST00000479030 518 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 AC091180.4-201ENST00000511322 245 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 AC009884.1-201ENST00000522670 545 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
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