Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 RN7SKP92-201ENST00000517266 244 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 LINC02365-202ENST00000520280 607 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 OR8A2P-201ENST00000528631 952 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 ASB8-204ENST00000536071 568 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 ARL1-211ENST00000551828 776 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 AL355095.1-201ENST00000554451 539 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 FAM106CP-201ENST00000582212 507 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 ALG13-230ENST00000623189 458 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 AP002512.4-202ENST00000641599 4530 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 LINC02493-201ENST00000509964 1704 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 AC005162.3-201ENST00000609389 3695 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 ALB-202ENST00000401494 1659 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 OR11H5P-202ENST00000641612 1325 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 AL138828.1-203ENST00000419926 1570 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 RPS5P7-201ENST00000456664 608 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 AC016559.2-201ENST00000510759 359 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 IGHV3-63-201ENST00000518422 341 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 AC099489.2-201ENST00000574976 260 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 DAB1-AS1-208ENST00000586465 748 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 DHX40P1-201ENST00000588725 1412 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 AL354733.2-209ENST00000589233 1434 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 LINC01081-201ENST00000597373 465 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 OR9G1-202ENST00000642097 3611 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 U3.22-201ENST00000391120 215 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 RNU2-22P-201ENST00000411266 212 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 AC104462.2-201ENST00000418402 271 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 AC073521.1-201ENST00000418679 625 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 AL355592.1-201ENST00000450292 386 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 AK3P4-201ENST00000504283 583 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 AC048387.1-201ENST00000518428 494 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 AP000859.1-201ENST00000525536 307 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 AC044810.3-201ENST00000527565 589 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.3 ms