Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 AC108078.3-201ENST00000502633 489 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AC106821.1-201ENST00000502861 572 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 OR5H5P-201ENST00000503164 928 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AC104090.1-201ENST00000506341 1171 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AC010468.2-201ENST00000511981 438 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 Y_RNA.717-201ENST00000517106 92 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 RNU6-1231P-201ENST00000517185 103 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AC090802.1-201ENST00000520870 445 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AP001330.2-201ENST00000523121 979 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 RAP1B-224ENST00000541216 701 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AC023050.2-201ENST00000544968 387 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AC023161.2-201ENST00000551218 780 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 SPIC-201ENST00000551346 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AC025588.2-201ENST00000604851 466 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AL513477.2-201ENST00000607858 568 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AC069209.1-201ENST00000619282 651 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AP004289.2-201ENST00000444413 1457 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AP000776.1-201ENST00000530032 1663 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 MTND5P3-201ENST00000438536 1800 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC3.38□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC3.38□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 Z85994.1-201ENST00000406912 606 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AL589946.1-201ENST00000421465 420 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 NAALADL2-AS2-201ENST00000424690 1038 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 TTC3-AS1-201ENST00000424733 1097 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 MTND2P20-201ENST00000440805 661 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 RPL21P133-201ENST00000443666 476 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AC099566.1-212ENST00000451675 799 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC3.38□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 FCF1P3-201ENST00000496394 590 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AC138057.1-201ENST00000497258 696 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AC034223.2-201ENST00000511840 425 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 RNU6-352P-201ENST00000516908 107 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AP001636.2-201ENST00000525517 696 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AL354920.1-202ENST00000531661 1017 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 REXO2-218ENST00000544827 880 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AC010198.2-201ENST00000550612 259 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AC016382.1-201ENST00000583580 387 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AC022916.3-201ENST00000592961 742 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AC024603.1-201ENST00000597938 592 ntTSL 4 BASIC3.38□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AL365503.1-201ENST00000605247 905 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AC124312.4-201ENST00000605533 310 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AC097478.2-201ENST00000610572 514 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 DAOA-AS1_2.2-201ENST00000610818 204 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 ATXN3L-202ENST00000622204 837 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 OR6C2-203ENST00000641516 1682 ntAPPRIS P1 BASIC3.38□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 RMDN2-204ENST00000406384 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 ZNF733P-201ENST00000331425 1506 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AC004852.2-204ENST00000614137 1370 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AC007390.1-201ENST00000415722 356 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 CBLL1-202ENST00000415884 804 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 MTCYBP24-201ENST00000420387 1106 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AC106873.1-201ENST00000420664 459 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.8 ms