Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 NRBF2P3-201ENST00000432731 865 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 TTTY17B-201ENST00000441906 166 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 ARL2BPP10-201ENST00000446487 531 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 AL133244.1-201ENST00000456007 258 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 AC073429.1-201ENST00000511749 503 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 AC063950.1-201ENST00000552036 308 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 AC009117.3-202ENST00000563825 557 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 TEX41-238ENST00000604253 709 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 AC119674.1-207ENST00000641355 633 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 FAM69A-202ENST00000613047 2646 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 SLCO1C1-208ENST00000545102 2868 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 MKI67-201ENST00000368653 11417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 OFD1P9Y-201ENST00000417699 1491 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 MYOT-202ENST00000421631 1474 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 ABCC13-202ENST00000463099 3842 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 PPFIBP1-201ENST00000228425 5933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 TRIM36-209ENST00000514154 1952 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 RAPGEF2-201ENST00000264431 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 BX664718.1-201ENST00000439824 3224 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 LINC01951-201ENST00000377300 1925 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 RYR3-202ENST00000415757 15557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 ZNF571-203ENST00000451802 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 MPDZ-219ENST00000546205 6342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 AP001803.2-201ENST00000532274 2034 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 UNC5C-205ENST00000610318 9403 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 DEFB4B-201ENST00000318157 332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
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PTPRAP18433 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 SNORA70.10-201ENST00000384515 134 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 RPL31-205ENST00000409320 716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 BX510359.2-201ENST00000417920 305 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
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PTPRAP18433 AC114495.1-201ENST00000441274 436 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 AL031668.1-201ENST00000451556 603 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
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PTPRAP18433 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 AL583810.3-201ENST00000555713 584 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
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PTPRAP18433 TVP23CP2-201ENST00000571473 623 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
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PTPRAP18433 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
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PTPRAP18433 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 LINC00976-202ENST00000628064 534 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 WDR89-201ENST00000267522 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 RNMT-201ENST00000262173 6051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 HMMR-204ENST00000432118 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 FAM184A-204ENST00000368475 3392 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 LINC01152-201ENST00000472655 3578 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 RAD17-201ENST00000282891 2135 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
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