Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CGGBP1Q9UFW8 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CGGBP1Q9UFW8 AC004882.2-201ENST00000420180 244 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CGGBP1Q9UFW8 AC005517.2-201ENST00000424673 553 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CGGBP1Q9UFW8 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CGGBP1Q9UFW8 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CGGBP1Q9UFW8 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CGGBP1Q9UFW8 AC073465.2-201ENST00000440938 498 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CGGBP1Q9UFW8 AC064862.4-201ENST00000442180 334 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CGGBP1Q9UFW8 AL161636.2-201ENST00000445179 927 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CGGBP1Q9UFW8 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CGGBP1Q9UFW8 RPS23P6-201ENST00000466136 431 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CGGBP1Q9UFW8 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CGGBP1Q9UFW8 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CGGBP1Q9UFW8 RN7SKP13-201ENST00000515933 244 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CGGBP1Q9UFW8 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CGGBP1Q9UFW8 IGLV3-24-201ENST00000517477 197 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CGGBP1Q9UFW8 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CGGBP1Q9UFW8 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CGGBP1Q9UFW8 AC090022.1-201ENST00000546569 311 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CGGBP1Q9UFW8 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CGGBP1Q9UFW8 AC012588.1-201ENST00000583852 358 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CGGBP1Q9UFW8 Z98949.1-203ENST00000597284 851 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CGGBP1Q9UFW8 AL008729.2-201ENST00000606393 473 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CGGBP1Q9UFW8 AP001521.2-201ENST00000608772 546 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CGGBP1Q9UFW8 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CGGBP1Q9UFW8 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CGGBP1Q9UFW8 LINC01620-204ENST00000623295 700 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CGGBP1Q9UFW8 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CGGBP1Q9UFW8 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CGGBP1Q9UFW8 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CGGBP1Q9UFW8 EOGT-209ENST00000540955 1332 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CGGBP1Q9UFW8 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CGGBP1Q9UFW8 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CGGBP1Q9UFW8 AL442639.1-201ENST00000625030 1899 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CGGBP1Q9UFW8 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CGGBP1Q9UFW8 BCLAF1P2-201ENST00000624956 2609 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CGGBP1Q9UFW8 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CGGBP1Q9UFW8 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CGGBP1Q9UFW8 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CGGBP1Q9UFW8 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CGGBP1Q9UFW8 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CGGBP1Q9UFW8 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
CGGBP1Q9UFW8 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CGGBP1Q9UFW8 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
CGGBP1Q9UFW8 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
CGGBP1Q9UFW8 ZNF273-204ENST00000476120 2000 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CGGBP1Q9UFW8 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CGGBP1Q9UFW8 EIF2AP4-201ENST00000424793 1781 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CGGBP1Q9UFW8 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CGGBP1Q9UFW8 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
CGGBP1Q9UFW8 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CGGBP1Q9UFW8 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CGGBP1Q9UFW8 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CGGBP1Q9UFW8 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CGGBP1Q9UFW8 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CGGBP1Q9UFW8 HNRNPA3P4-201ENST00000427514 803 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CGGBP1Q9UFW8 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CGGBP1Q9UFW8 RNF219-AS1-202ENST00000444769 590 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CGGBP1Q9UFW8 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CGGBP1Q9UFW8 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CGGBP1Q9UFW8 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
CGGBP1Q9UFW8 AL049874.2-201ENST00000492636 288 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CGGBP1Q9UFW8 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CGGBP1Q9UFW8 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CGGBP1Q9UFW8 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CGGBP1Q9UFW8 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CGGBP1Q9UFW8 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CGGBP1Q9UFW8 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CGGBP1Q9UFW8 AC062004.1-202ENST00000524014 246 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CGGBP1Q9UFW8 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CGGBP1Q9UFW8 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CGGBP1Q9UFW8 AC127381.1-201ENST00000555979 939 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CGGBP1Q9UFW8 AC009562.1-202ENST00000558755 565 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CGGBP1Q9UFW8 AC079203.2-201ENST00000559867 387 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CGGBP1Q9UFW8 AC019322.1-201ENST00000571869 389 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CGGBP1Q9UFW8 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CGGBP1Q9UFW8 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CGGBP1Q9UFW8 PPIAL4F-202ENST00000581138 660 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CGGBP1Q9UFW8 PPIAL4E-201ENST00000581164 785 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CGGBP1Q9UFW8 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CGGBP1Q9UFW8 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CGGBP1Q9UFW8 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CGGBP1Q9UFW8 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CGGBP1Q9UFW8 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CGGBP1Q9UFW8 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CGGBP1Q9UFW8 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CGGBP1Q9UFW8 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CGGBP1Q9UFW8 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CGGBP1Q9UFW8 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CGGBP1Q9UFW8 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CGGBP1Q9UFW8 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CGGBP1Q9UFW8 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CGGBP1Q9UFW8 AL022394.1-201ENST00000606979 292 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CGGBP1Q9UFW8 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CGGBP1Q9UFW8 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CGGBP1Q9UFW8 AP005431.1-201ENST00000618479 319 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CGGBP1Q9UFW8 AL691477.1-201ENST00000624398 162 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CGGBP1Q9UFW8 LINC01002-236ENST00000634022 378 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CGGBP1Q9UFW8 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.1 ms