Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 EEF1B2P4-201ENST00000551398 348 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TRAPPC9Q96Q05 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
TRAPPC9Q96Q05 AL352979.3-201ENST00000553515 247 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TRAPPC9Q96Q05 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
TRAPPC9Q96Q05 AP005136.1-201ENST00000579765 429 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TRAPPC9Q96Q05 AC064805.2-201ENST00000582959 523 ntTSL 4 BASIC4.29□□□□□ -1.72
TRAPPC9Q96Q05 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TRAPPC9Q96Q05 MIR7515HG-243ENST00000591400 1067 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
TRAPPC9Q96Q05 AL031985.2-201ENST00000600955 480 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TRAPPC9Q96Q05 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TRAPPC9Q96Q05 MIR432-201ENST00000606207 94 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TRAPPC9Q96Q05 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TRAPPC9Q96Q05 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TRAPPC9Q96Q05 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TRAPPC9Q96Q05 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
TRAPPC9Q96Q05 SLC38A9-223ENST00000515629 2673 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
TRAPPC9Q96Q05 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TRAPPC9Q96Q05 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
TRAPPC9Q96Q05 PNPT1P2-201ENST00000456768 2050 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TRAPPC9Q96Q05 POSTN-202ENST00000379743 3196 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
TRAPPC9Q96Q05 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
TRAPPC9Q96Q05 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
TRAPPC9Q96Q05 ADGRL2-210ENST00000370728 6302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
TRAPPC9Q96Q05 AKAP6-201ENST00000280979 15006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
TRAPPC9Q96Q05 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TRAPPC9Q96Q05 GABRB2-203ENST00000393959 7191 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
TRAPPC9Q96Q05 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TRAPPC9Q96Q05 RIMS1-204ENST00000401910 3542 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TRAPPC9Q96Q05 ASAH1-265ENST00000637922 2297 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TRAPPC9Q96Q05 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TRAPPC9Q96Q05 NFAT5-203ENST00000393742 13067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
TRAPPC9Q96Q05 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TRAPPC9Q96Q05 DNAH8-202ENST00000359357 13864 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TRAPPC9Q96Q05 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
TRAPPC9Q96Q05 LGALS13-201ENST00000221797 602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
TRAPPC9Q96Q05 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
TRAPPC9Q96Q05 AL672167.1-206ENST00000356293 943 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TRAPPC9Q96Q05 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TRAPPC9Q96Q05 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TRAPPC9Q96Q05 Z98941.1-201ENST00000407764 100 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TRAPPC9Q96Q05 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TRAPPC9Q96Q05 RHEBP3-201ENST00000411920 351 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TRAPPC9Q96Q05 AC127526.1-201ENST00000417526 366 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TRAPPC9Q96Q05 MAP1LC3BP1-201ENST00000417653 379 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TRAPPC9Q96Q05 LINC01074-201ENST00000422527 555 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TRAPPC9Q96Q05 RWDD4P2-201ENST00000426392 563 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TRAPPC9Q96Q05 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TRAPPC9Q96Q05 SCP2-206ENST00000430330 938 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TRAPPC9Q96Q05 RPS29P17-201ENST00000430795 166 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TRAPPC9Q96Q05 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TRAPPC9Q96Q05 CBX1P1-201ENST00000440184 427 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TRAPPC9Q96Q05 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TRAPPC9Q96Q05 AC006042.4-201ENST00000451066 692 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TRAPPC9Q96Q05 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TRAPPC9Q96Q05 RPS27AP17-201ENST00000463344 455 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TRAPPC9Q96Q05 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TRAPPC9Q96Q05 AL024509.2-201ENST00000493462 493 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TRAPPC9Q96Q05 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TRAPPC9Q96Q05 AC021678.1-201ENST00000505195 936 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TRAPPC9Q96Q05 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TRAPPC9Q96Q05 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TRAPPC9Q96Q05 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TRAPPC9Q96Q05 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TRAPPC9Q96Q05 AP001992.1-204ENST00000525104 687 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TRAPPC9Q96Q05 HIGD1AP10-201ENST00000527837 282 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TRAPPC9Q96Q05 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TRAPPC9Q96Q05 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TRAPPC9Q96Q05 GTF2IP22-201ENST00000554443 182 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TRAPPC9Q96Q05 AC026992.1-202ENST00000558454 421 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TRAPPC9Q96Q05 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TRAPPC9Q96Q05 AC008507.1-201ENST00000587506 734 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TRAPPC9Q96Q05 BNIP3P23-201ENST00000599655 511 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TRAPPC9Q96Q05 AL358072.1-201ENST00000604156 575 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TRAPPC9Q96Q05 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TRAPPC9Q96Q05 AP002360.3-201ENST00000607673 710 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TRAPPC9Q96Q05 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TRAPPC9Q96Q05 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TRAPPC9Q96Q05 AC244196.2-201ENST00000621184 411 ntAPPRIS P1 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TRAPPC9Q96Q05 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TRAPPC9Q96Q05 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TRAPPC9Q96Q05 TMEM67-202ENST00000409623 3255 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TRAPPC9Q96Q05 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
TRAPPC9Q96Q05 EIF2S1-202ENST00000466499 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
TRAPPC9Q96Q05 SLC30A6-205ENST00000435660 4776 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
TRAPPC9Q96Q05 ZNF962P-201ENST00000443465 3140 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TRAPPC9Q96Q05 MLH1-212ENST00000455445 2296 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
TRAPPC9Q96Q05 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
TRAPPC9Q96Q05 DEFB129-201ENST00000246105 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
TRAPPC9Q96Q05 OR5P1P-201ENST00000299512 925 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TRAPPC9Q96Q05 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC4.27□□□□□ -1.73
TRAPPC9Q96Q05 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
TRAPPC9Q96Q05 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TRAPPC9Q96Q05 AL133343.3-201ENST00000413983 469 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
TRAPPC9Q96Q05 AL139095.3-201ENST00000419672 1203 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TRAPPC9Q96Q05 MOBP-206ENST00000428261 561 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.27□□□□□ -1.73
TRAPPC9Q96Q05 RPL23AP25-201ENST00000430973 463 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TRAPPC9Q96Q05 AL365184.2-201ENST00000431139 435 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TRAPPC9Q96Q05 AC007285.2-201ENST00000433088 518 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
TRAPPC9Q96Q05 MRPS18BP2-201ENST00000434310 759 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms