Protein–RNA interactions for Protein: Q8IU54

IFNL1, Interferon lambda-1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNL1Q8IU54 MIR6730-201ENST00000622213 67 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
IFNL1Q8IU54 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
IFNL1Q8IU54 MLLT10-202ENST00000377059 4850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
IFNL1Q8IU54 FAM197Y2-202ENST00000448006 2338 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
IFNL1Q8IU54 DAZ3-201ENST00000315357 3277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
IFNL1Q8IU54 DAZ2-201ENST00000382294 3277 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
IFNL1Q8IU54 DAZ4-204ENST00000415508 3277 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
IFNL1Q8IU54 SLC30A8-205ENST00000519688 5242 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
IFNL1Q8IU54 AIMP1-203ENST00000442366 2519 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
IFNL1Q8IU54 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
IFNL1Q8IU54 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
IFNL1Q8IU54 LINC02179-201ENST00000561523 3673 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
IFNL1Q8IU54 ZNF254-206ENST00000611359 3982 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
IFNL1Q8IU54 CD101-202ENST00000369470 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
IFNL1Q8IU54 NFIB-204ENST00000380953 2381 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
IFNL1Q8IU54 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
IFNL1Q8IU54 ALPK2-201ENST00000361673 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
IFNL1Q8IU54 AL160408.3-201ENST00000442382 3564 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
IFNL1Q8IU54 SLC35F1-202ENST00000621341 4481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
IFNL1Q8IU54 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
IFNL1Q8IU54 FCF1-201ENST00000341162 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
IFNL1Q8IU54 AL445487.1-201ENST00000415694 1580 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
IFNL1Q8IU54 CLEC2D-201ENST00000261339 465 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
IFNL1Q8IU54 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
IFNL1Q8IU54 RNU1-134P-201ENST00000362935 165 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
IFNL1Q8IU54 SNORA58B-201ENST00000364259 136 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
IFNL1Q8IU54 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
IFNL1Q8IU54 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
IFNL1Q8IU54 AC116036.1-201ENST00000412199 367 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
IFNL1Q8IU54 SDHDP6-201ENST00000414693 480 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
IFNL1Q8IU54 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
IFNL1Q8IU54 AC108488.1-202ENST00000439547 482 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
IFNL1Q8IU54 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
IFNL1Q8IU54 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC7.35□□□□□ -1.23
IFNL1Q8IU54 AL157371.1-201ENST00000451910 394 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
IFNL1Q8IU54 RN7SL714P-201ENST00000487050 298 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
IFNL1Q8IU54 AC004889.1-208ENST00000489077 423 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
IFNL1Q8IU54 AC083906.1-201ENST00000509298 406 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
IFNL1Q8IU54 RNA5SP362-201ENST00000516048 118 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
IFNL1Q8IU54 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
IFNL1Q8IU54 RNA5SP434-201ENST00000516647 121 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
IFNL1Q8IU54 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
IFNL1Q8IU54 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
IFNL1Q8IU54 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
IFNL1Q8IU54 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
IFNL1Q8IU54 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
IFNL1Q8IU54 CCT5-215ENST00000625723 135 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
IFNL1Q8IU54 PFKM-232ENST00000629846 381 ntTSL 4 BASIC7.35□□□□□ -1.23
IFNL1Q8IU54 AOAH-210ENST00000617267 2398 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
IFNL1Q8IU54 PJA2-201ENST00000361189 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
IFNL1Q8IU54 MEIS1-201ENST00000272369 4291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
IFNL1Q8IU54 DCP2-201ENST00000389063 8947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
IFNL1Q8IU54 AMY1B-202ENST00000370080 1787 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
IFNL1Q8IU54 USP37-201ENST00000258399 8032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
IFNL1Q8IU54 SLC2A14-221ENST00000616981 3366 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
IFNL1Q8IU54 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
IFNL1Q8IU54 EFCAB6-203ENST00000396231 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
IFNL1Q8IU54 LINC01441-201ENST00000433766 2290 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
IFNL1Q8IU54 ARPP21-204ENST00000412048 2506 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
IFNL1Q8IU54 AC078880.4-201ENST00000617627 1749 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
IFNL1Q8IU54 FAM111A-201ENST00000361723 3592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
IFNL1Q8IU54 COL21A1-203ENST00000370819 4094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
IFNL1Q8IU54 PMFBP1-202ENST00000355636 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
IFNL1Q8IU54 PLEKHA1-205ENST00000433307 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
IFNL1Q8IU54 AC026464.2-201ENST00000567834 2421 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
IFNL1Q8IU54 ZFHX3-207ENST00000641206 16414 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
IFNL1Q8IU54 PTPN3-203ENST00000412145 8765 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
IFNL1Q8IU54 AKAP5-202ENST00000394718 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
IFNL1Q8IU54 HP1BP3-203ENST00000375003 4822 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
IFNL1Q8IU54 ADGRL3-214ENST00000511324 5042 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
IFNL1Q8IU54 KCNJ15-220ENST00000612702 3046 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.34□□□□□ -1.23
IFNL1Q8IU54 MYO3B-203ENST00000409044 5448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
IFNL1Q8IU54 HEPH-203ENST00000419594 3694 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
IFNL1Q8IU54 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
IFNL1Q8IU54 SEM1-202ENST00000356686 2667 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
IFNL1Q8IU54 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
IFNL1Q8IU54 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
IFNL1Q8IU54 C1QTNF7-201ENST00000295297 4516 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
IFNL1Q8IU54 KRTAP23-1-201ENST00000334160 211 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
IFNL1Q8IU54 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
IFNL1Q8IU54 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
IFNL1Q8IU54 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
IFNL1Q8IU54 MIR1203-201ENST00000408812 85 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
IFNL1Q8IU54 RPL23AP26-201ENST00000412728 464 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
IFNL1Q8IU54 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
IFNL1Q8IU54 AF064858.3-201ENST00000419664 509 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
IFNL1Q8IU54 STXBP5-AS1-204ENST00000431143 644 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
IFNL1Q8IU54 GAPDHP58-201ENST00000438477 1006 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
IFNL1Q8IU54 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
IFNL1Q8IU54 AL445665.1-202ENST00000452436 324 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
IFNL1Q8IU54 RN7SL515P-201ENST00000463999 297 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
IFNL1Q8IU54 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
IFNL1Q8IU54 RPL21P6-201ENST00000479171 504 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
IFNL1Q8IU54 AC108043.1-201ENST00000512696 574 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
IFNL1Q8IU54 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
IFNL1Q8IU54 AL390816.1-201ENST00000553990 322 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
IFNL1Q8IU54 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
IFNL1Q8IU54 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
IFNL1Q8IU54 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
IFNL1Q8IU54 AC211433.2-201ENST00000608433 387 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.6 ms