Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 AC009468.1-201ENST00000412800 437 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 AL513175.1-201ENST00000431492 780 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 AC093663.2-201ENST00000484625 313 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 AC134669.2-201ENST00000578584 1008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 NF1P10-201ENST00000613227 742 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 AP003072.4-201ENST00000624580 310 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 OR5H15-202ENST00000641450 1229 ntAPPRIS P1 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 NUCB2-220ENST00000622082 1369 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 DCAF13P1-201ENST00000495256 1330 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 ATP6V1G3-201ENST00000281087 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 ATP6V1G3-202ENST00000309309 678 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 DEFB106A-201ENST00000335186 303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 DEFB106B-201ENST00000335479 316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 CFHR4-203ENST00000367418 1066 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 MRRF-203ENST00000373723 1176 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 KRTAP27-1-201ENST00000382835 682 ntAPPRIS P1 BASIC3.35□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 AF178030.1-201ENST00000415088 402 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 TRGV6-201ENST00000417928 299 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 LINC00603-201ENST00000507027 733 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 MGAT4D-203ENST00000511113 1125 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 RNU4-18P-201ENST00000516751 149 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 AL161751.1-201ENST00000555636 1044 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 AL356022.1-201ENST00000557465 483 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 AL353708.2-201ENST00000567486 447 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 AC010615.3-201ENST00000597319 394 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 PLSCR2-206ENST00000610787 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 GCSAML-206ENST00000527084 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 CEP290-202ENST00000397838 2421 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC3.34□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 LSM5-205ENST00000409952 687 ntTSL 4 BASIC3.34□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 LSM5-206ENST00000409987 504 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 AL355994.1-201ENST00000424379 260 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 MTCYBP14-201ENST00000457471 715 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 AC090071.1-201ENST00000507713 644 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 AL049874.4-201ENST00000557593 255 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 USP44-208ENST00000552440 1818 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
ZBED9Q6R2W3 AC087565.3-202ENST00000642085 1603 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
ZBED9Q6R2W3 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.62-201ENST00000362840 99 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
ZBED9Q6R2W3 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
ZBED9Q6R2W3 OFD1P11Y-201ENST00000418213 1177 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
ZBED9Q6R2W3 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
ZBED9Q6R2W3 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
ZBED9Q6R2W3 AC016903.1-201ENST00000444017 588 ntTSL 4 BASIC3.33□□□□□ -1.88
ZBED9Q6R2W3 AC005002.1-201ENST00000447458 540 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
ZBED9Q6R2W3 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
ZBED9Q6R2W3 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
ZBED9Q6R2W3 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
ZBED9Q6R2W3 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
ZBED9Q6R2W3 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
ZBED9Q6R2W3 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC3.33□□□□□ -1.88
ZBED9Q6R2W3 AB015752.1-201ENST00000521975 578 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
ZBED9Q6R2W3 AC084033.1-201ENST00000550830 633 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
ZBED9Q6R2W3 AC072062.1-205ENST00000595058 962 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
ZBED9Q6R2W3 MIMT1-201ENST00000597105 1050 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
ZBED9Q6R2W3 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
ZBED9Q6R2W3 RMST_5.1-201ENST00000618704 126 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
ZBED9Q6R2W3 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
ZBED9Q6R2W3 AC138649.5-201ENST00000637456 137 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
ZBED9Q6R2W3 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
ZBED9Q6R2W3 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
ZBED9Q6R2W3 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
ZBED9Q6R2W3 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
ZBED9Q6R2W3 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
ZBED9Q6R2W3 AL645465.1-201ENST00000417765 642 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
ZBED9Q6R2W3 AC073310.1-201ENST00000423226 1033 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
ZBED9Q6R2W3 MTCO2P17-201ENST00000424336 677 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
ZBED9Q6R2W3 GNGT1-204ENST00000430875 628 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
ZBED9Q6R2W3 AL022310.1-201ENST00000436974 690 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
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