Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 AL359535.1-201ENST00000612100 1087 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 AC092192.1-201ENST00000633154 1018 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 OR1C1-202ENST00000641256 3719 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 FNBP1L-206ENST00000604705 1830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 LPAR4-201ENST00000435339 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 MTND5P24-201ENST00000438892 1767 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 OR8J3-203ENST00000641913 3047 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 UNC13C-201ENST00000260323 12946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 ZNF208-207ENST00000609966 3653 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 EIF2S1-202ENST00000466499 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 TSHB-201ENST00000256592 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 FAM26F-203ENST00000368606 546 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 AL121978.1-201ENST00000402778 359 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 AC004987.3-201ENST00000413879 771 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 AC108681.1-202ENST00000417384 589 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 UTS2B-203ENST00000427544 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 B3GNT2P1-201ENST00000434960 952 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 TBCAP1-201ENST00000436520 327 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 AC008278.2-201ENST00000438178 409 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 RPL36AP33-201ENST00000450395 310 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 PPIAP3-201ENST00000450588 505 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 AC012158.1-204ENST00000483430 465 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 AC012170.1-201ENST00000495139 359 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 AC090673.1-204ENST00000504038 977 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 MYLK-AS2-202ENST00000515464 754 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 RNA5SP154-201ENST00000516193 111 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 AP002812.3-201ENST00000527012 551 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 AP001029.2-202ENST00000588197 739 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 AC020914.6-201ENST00000594327 272 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 AC069304.2-201ENST00000605154 435 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 FAM157B-203ENST00000639350 358 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 NFIB-210ENST00000543693 7622 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 CRISP1-202ENST00000335847 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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CCDC93Q567U6 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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CCDC93Q567U6 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC93Q567U6 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
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CCDC93Q567U6 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
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CCDC93Q567U6 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC93Q567U6 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC93Q567U6 NANOGP10-201ENST00000453325 895 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC93Q567U6 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC93Q567U6 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC93Q567U6 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC93Q567U6 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC93Q567U6 RN7SL323P-201ENST00000494712 295 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC93Q567U6 AC108078.3-201ENST00000502633 489 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC93Q567U6 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC93Q567U6 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC93Q567U6 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC93Q567U6 AC027801.4-201ENST00000518420 395 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC93Q567U6 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC93Q567U6 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC93Q567U6 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC93Q567U6 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC93Q567U6 AC013437.1-201ENST00000549878 414 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC93Q567U6 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC93Q567U6 AC012170.2-201ENST00000560380 667 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC93Q567U6 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC93Q567U6 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC93Q567U6 AC008638.3-201ENST00000603341 463 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
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