Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC3.15□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 CACNA1C-IT2-201ENST00000541871 589 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 AL161896.1-201ENST00000597248 508 ntTSL 4 BASIC3.15□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 AL450489.1-201ENST00000612071 468 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 AL162233.1-201ENST00000620014 944 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 CSNK1G3-210ENST00000521364 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 OFD1P6Y-201ENST00000432335 1637 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 TTTY9B-201ENST00000433794 1637 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 PNPT1P2-201ENST00000456768 2050 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 NCOA1-203ENST00000395856 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 RNU6-253P-201ENST00000384730 105 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 ERMN-209ENST00000420719 1246 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 RLIMP2-201ENST00000427891 1563 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 AL109761.1-201ENST00000428689 422 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 BTG3P1-201ENST00000435859 716 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 AC010157.1-201ENST00000440589 527 ntTSL 4 BASIC3.14□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 SATB1-AS1-204ENST00000453361 726 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 AC098583.1-201ENST00000480875 255 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 AC016933.1-201ENST00000504735 539 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC3.14□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 AC007688.2-201ENST00000545158 369 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC3.14□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC3.14□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 ZNF480-202ENST00000335090 2722 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 CR382285.2-201ENST00000624662 1495 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC3.13□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 USP9YP5-201ENST00000511770 630 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 SNORA70.14-201ENST00000516205 110 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 AC018616.1-201ENST00000524085 546 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 AC099566.1-211ENST00000595188 737 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 FRG1DP-201ENST00000635586 771 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 LIPI-201ENST00000344577 1652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 LANCL1-AS1-201ENST00000416344 714 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 NREP-207ENST00000450761 636 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.13□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 AC104827.1-202ENST00000511917 1049 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 ZNF84-212ENST00000542874 540 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 AL845331.3-202ENST00000562856 261 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 GTF2H2B-203ENST00000508065 1432 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 EXOC5P1-201ENST00000510543 1969 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 RNA5SP239-201ENST00000410218 129 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 LINC01332-201ENST00000506612 502 ntTSL 4 BASIC3.12□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC3.12□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 NPM1P35-201ENST00000533043 868 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 AL389895.1-201ENST00000554127 252 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 Z99129.2-201ENST00000619967 314 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 AC009452.1-201ENST00000640823 606 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 AC107021.2-201ENST00000567714 2095 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 ZNF107-203ENST00000395391 6094 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 AC069218.2-201ENST00000411665 344 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 AC107081.1-201ENST00000414975 361 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 AC013268.2-201ENST00000420753 337 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 LINC01445-202ENST00000458615 679 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 AP000893.1-201ENST00000474462 794 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 AC147055.1-201ENST00000509261 750 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 AP001001.1-202ENST00000527594 692 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.4 ms