Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 TVP23BP2-201ENST00000455082 615 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 AC011405.1-202ENST00000504658 803 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 RRAS2-205ENST00000529237 1278 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 ATP13A5-205ENST00000620313 709 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 OR56A1-203ENST00000641900 8448 ntAPPRIS P1 BASIC2.45□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 CLEC2B-201ENST00000228438 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 MAL2-205ENST00000521048 575 ntTSL 4 BASIC2.45□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 AC004825.2-201ENST00000616634 455 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 AC010480.1-201ENST00000624823 684 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 IL23R-202ENST00000395227 1459 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 RNU2-17P-201ENST00000410290 190 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 LANCL1-AS1-201ENST00000416344 714 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 AC104090.1-201ENST00000506341 1171 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 HMGB1P19-201ENST00000517578 577 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 AL353743.4-201ENST00000422653 1547 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC2.43□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 AC007610.2-201ENST00000566770 666 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 OR8D1-202ENST00000641015 8286 ntAPPRIS P1 BASIC2.43□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 OR11H5P-202ENST00000641612 1325 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 AC104170.2-201ENST00000424246 678 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 AC026167.1-201ENST00000435651 299 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 AC018682.2-201ENST00000517716 399 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 RN7SL622P-201ENST00000585292 275 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 AL353684.1-201ENST00000622677 1120 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 HMGB1P10-201ENST00000395823 563 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 AC013410.1-201ENST00000436223 1232 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
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LAMA3Q16787 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 AC127526.1-201ENST00000417526 366 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 SETP4-201ENST00000455717 868 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 AC105918.1-201ENST00000474399 838 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 AP001542.2-201ENST00000593141 364 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 AC233280.2-201ENST00000603917 1070 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 C5orf63-207ENST00000606937 607 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 AC098484.2-201ENST00000414339 601 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 LINC02230-201ENST00000511174 301 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 CCNHP1-201ENST00000513311 678 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 MTCO2P17-201ENST00000424336 677 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 FER-202ENST00000438717 1531 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 AC005261.6-201ENST00000623072 1387 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
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