Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 AC108515.1-201ENST00000517407 525 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 AC019227.1-201ENST00000526902 510 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 LINC02384-206ENST00000541707 904 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 AC092747.2-201ENST00000545069 983 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 RN7SL339P-201ENST00000580597 296 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 AC135012.2-201ENST00000600234 479 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 AL158050.2-201ENST00000605336 568 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 AC024060.1-201ENST00000607052 494 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 AC009269.6-201ENST00000621778 588 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 AC110760.2-201ENST00000508031 2546 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 ARF4-206ENST00000489843 1360 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 TAS2R10-201ENST00000240619 1042 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 ZNF679-201ENST00000255746 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 CoTC_ribozyme.1-201ENST00000408104 192 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 Z93403.1-201ENST00000411879 895 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 OFD1P18Y-201ENST00000420889 959 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 C1DP1-201ENST00000426049 402 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 AC005345.1-201ENST00000431868 217 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 HSFY7P-201ENST00000432672 318 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 AC005208.1-201ENST00000435112 599 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 HSFY8P-201ENST00000437934 318 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 AC044781.1-201ENST00000446193 570 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 NEGR1-IT1-201ENST00000453121 534 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 HSFY5P-201ENST00000453726 309 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 MTATP6P14-201ENST00000455189 673 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 C1GALT1C1L-201ENST00000475092 1172 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 LINC01327-201ENST00000498413 535 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 PCBP2P3-201ENST00000509726 843 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 AC108467.1-201ENST00000515623 672 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 SKP1-210ENST00000522855 802 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 OR7E13P-201ENST00000526052 910 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 MTCYBP41-201ENST00000528913 1123 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 AC103843.2-201ENST00000530523 682 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 AC022367.1-202ENST00000535066 537 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 LINC02345-201ENST00000557883 766 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 ZFAND6-208ENST00000558688 780 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 AC005412.1-201ENST00000580812 1049 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 ELOCP35-201ENST00000604289 336 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 AC069209.1-201ENST00000619282 651 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 AC022306.3-201ENST00000619930 550 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 MFSD8-245ENST00000641743 948 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 RNU5E-10P-201ENST00000363506 118 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 AL133264.1-201ENST00000407157 562 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 VN1R51P-201ENST00000411675 945 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 MTCYBP24-201ENST00000420387 1106 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 RPL31P54-201ENST00000429803 370 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 AL360013.2-201ENST00000440104 807 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 AC099563.1-201ENST00000456086 418 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 AL358832.1-201ENST00000497800 389 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 BOLA3P3-201ENST00000505182 232 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 AC093752.1-206ENST00000511823 336 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 MTCO2P32-201ENST00000514865 403 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
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