Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 AL445488.1-201ENST00000457272 706 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 TPPP2-202ENST00000460647 568 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 LINC01192-207ENST00000492553 836 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 AC090833.1-201ENST00000513853 806 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 AC023932.1-201ENST00000582726 429 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 AP000873.2-201ENST00000602381 406 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 AC009220.3-201ENST00000604318 586 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 AC008083.4-201ENST00000615076 444 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 AC007275.1-201ENST00000621243 671 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 GCSAML-206ENST00000527084 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 CFHR4-203ENST00000367418 1066 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 SMC4P1-201ENST00000414479 527 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 AL389915.1-201ENST00000422463 466 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 AP002345.1-201ENST00000456493 928 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 AC114982.2-201ENST00000461396 358 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 RPS4XP6-201ENST00000477670 797 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 GAPDHP39-201ENST00000481866 979 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 C1GALT1P2-201ENST00000510813 1104 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 AC112673.1-201ENST00000513168 575 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 AC245036.5-201ENST00000596330 847 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 SNORA35B-201ENST00000607417 129 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 AC020923.1-201ENST00000624021 917 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 GOLT1B-210ENST00000631252 223 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
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NEDD8Q15843 RNU6-233P-201ENST00000410845 141 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 AL807761.1-201ENST00000417622 171 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 AC018644.1-201ENST00000429934 551 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 RPS7P2-201ENST00000435134 607 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 AC099677.4-201ENST00000446786 380 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 NUTF2P7-201ENST00000453086 375 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
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NEDD8Q15843 LINC01017-201ENST00000508823 768 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
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NEDD8Q15843 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
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NEDD8Q15843 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 AL392023.2-202ENST00000555342 494 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
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NEDD8Q15843 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 AL034549.1-201ENST00000615120 578 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 MMP13-203ENST00000615555 1152 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 AC015726.3-201ENST00000624501 418 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
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