Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 HSFY4P-201ENST00000415994 1181 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SS18Q15532 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SS18Q15532 AL357833.2-201ENST00000426811 430 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SS18Q15532 AC018644.1-201ENST00000429934 551 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SS18Q15532 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SS18Q15532 RSL24D1P8-201ENST00000434442 492 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SS18Q15532 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SS18Q15532 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SS18Q15532 RPL6P5-201ENST00000445678 828 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SS18Q15532 NPM1P13-201ENST00000452663 865 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SS18Q15532 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SS18Q15532 AC108729.2-201ENST00000476543 840 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SS18Q15532 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SS18Q15532 LINC02270-201ENST00000505386 610 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
SS18Q15532 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SS18Q15532 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SS18Q15532 AC104108.1-201ENST00000509930 412 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SS18Q15532 PAIP2-205ENST00000510080 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
SS18Q15532 AC133963.2-201ENST00000513686 578 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SS18Q15532 LINC02497-201ENST00000515292 507 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SS18Q15532 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SS18Q15532 AC011363.1-201ENST00000524198 458 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SS18Q15532 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SS18Q15532 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SS18Q15532 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SS18Q15532 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SS18Q15532 MTCYBP28-201ENST00000566728 1132 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SS18Q15532 LINC02520-201ENST00000570443 537 ntTSL 4 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SS18Q15532 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SS18Q15532 AC105094.2-203ENST00000590357 555 ntTSL 4 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SS18Q15532 AC007566.2-201ENST00000603642 413 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SS18Q15532 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SS18Q15532 AL034549.1-201ENST00000615120 578 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SS18Q15532 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SS18Q15532 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SS18Q15532 CNBD1-207ENST00000620844 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SS18Q15532 AP000676.4-201ENST00000624659 623 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SS18Q15532 AL590396.2-201ENST00000636511 1041 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SS18Q15532 MEG8-222ENST00000637332 1237 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SS18Q15532 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
SS18Q15532 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SS18Q15532 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SS18Q15532 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SS18Q15532 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
SS18Q15532 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SS18Q15532 OR5T1-202ENST00000641665 1471 ntAPPRIS P1 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SS18Q15532 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
SS18Q15532 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SS18Q15532 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SS18Q15532 MTND4P21-201ENST00000453886 1357 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SS18Q15532 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
SS18Q15532 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SS18Q15532 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
SS18Q15532 MRRF-203ENST00000373723 1176 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SS18Q15532 RNU6-1005P-201ENST00000384519 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SS18Q15532 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SS18Q15532 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SS18Q15532 SNORA11C-201ENST00000408532 129 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SS18Q15532 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SS18Q15532 RPS7P15-201ENST00000415804 584 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SS18Q15532 MTCYBP24-201ENST00000420387 1106 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SS18Q15532 ENOX1-AS2-201ENST00000434273 609 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SS18Q15532 YWHAZP8-201ENST00000436935 731 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SS18Q15532 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SS18Q15532 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SS18Q15532 DNAJC19P8-201ENST00000452887 259 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SS18Q15532 AC093157.1-204ENST00000454721 753 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SS18Q15532 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SS18Q15532 HESX1-202ENST00000473921 757 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SS18Q15532 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SS18Q15532 SOX2-OT-207ENST00000476964 606 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
SS18Q15532 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
SS18Q15532 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SS18Q15532 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SS18Q15532 ZBTB20-AS3-201ENST00000498630 464 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SS18Q15532 AC021678.1-201ENST00000505195 936 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SS18Q15532 SEMA6A-AS2-201ENST00000508766 482 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SS18Q15532 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SS18Q15532 RNU6-362P-201ENST00000516736 90 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SS18Q15532 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SS18Q15532 LINC00535-204ENST00000520513 305 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SS18Q15532 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SS18Q15532 RGS4-207ENST00000527809 817 ntTSL 4 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SS18Q15532 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
SS18Q15532 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SS18Q15532 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SS18Q15532 SYNE2-210ENST00000553455 674 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SS18Q15532 NCAPGP2-201ENST00000557911 754 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SS18Q15532 AL731537.2-201ENST00000561565 951 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SS18Q15532 ATP5F1P7-201ENST00000567330 760 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SS18Q15532 FOPNL-208ENST00000575744 565 ntTSL 4 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SS18Q15532 AC017100.2-201ENST00000584628 355 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SS18Q15532 AC091132.5-202ENST00000587078 501 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SS18Q15532 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SS18Q15532 AC008687.2-201ENST00000597865 520 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SS18Q15532 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SS18Q15532 AC003001.2-201ENST00000616294 831 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SS18Q15532 AC073569.3-201ENST00000619055 682 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SS18Q15532 AC006249.1-201ENST00000621223 471 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SS18Q15532 AC022509.4-201ENST00000621404 572 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.2 ms