Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 AC007673.1-201ENST00000590604 1100 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 AC107905.1-201ENST00000616204 426 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 AL391597.1-201ENST00000618707 694 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 AC024341.1-201ENST00000526444 1552 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 RNU6-98P-201ENST00000384173 107 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 AL592437.1-201ENST00000443781 492 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 RNU6-491P-201ENST00000516099 110 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 AC027031.1-201ENST00000517318 489 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 AC023908.1-201ENST00000559899 567 ntTSL 4 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 AC096947.1-201ENST00000603233 470 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 ELOCP35-201ENST00000604289 336 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 VIS1.1-201ENST00000610517 203 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 STATH-208ENST00000615994 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 AC138393.3-201ENST00000618397 573 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 AP000676.4-201ENST00000624659 623 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 LINC02070-201ENST00000460586 1321 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 ALG6-201ENST00000263440 1895 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 AC008629.1-202ENST00000504820 525 ntTSL 4 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 WBP1LP4-201ENST00000505043 344 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 RN7SKP283-201ENST00000517197 270 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 AC084033.1-201ENST00000550830 633 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 AC015727.1-201ENST00000572792 512 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 AC022509.4-201ENST00000621404 572 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 AC011242.1-201ENST00000433596 1158 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 GAPDHP39-201ENST00000481866 979 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 LINC01455-201ENST00000503167 561 ntTSL 4 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 DYNLL1P6-201ENST00000503440 264 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 AC111000.2-201ENST00000507775 550 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 LINC02113-201ENST00000510302 336 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 OR4G1P-201ENST00000588632 938 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 NTAN1P1-201ENST00000603150 646 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 AC110792.4-201ENST00000609843 298 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 AC138932.5-201ENST00000617759 563 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
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