Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 LSM3P2-201ENST00000551246 273 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 AC079075.1-201ENST00000559543 878 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 AC068397.1-201ENST00000560337 531 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 AC142086.4-201ENST00000568904 650 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 RN7SL356P-201ENST00000582228 248 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 LINC01909-202ENST00000584919 815 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 AC022098.3-201ENST00000590715 315 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 AC097467.3-204ENST00000595229 827 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 AL034351.1-201ENST00000605288 668 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 MIR7155-201ENST00000615925 56 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 ATXN3-251ENST00000617719 1074 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 AP005264.7-201ENST00000625003 745 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 AC006994.2-202ENST00000639259 3828 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 RNU1-77P-201ENST00000390868 162 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 FRMPD3-AS1-201ENST00000415252 457 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 TXNIP-201ENST00000425134 1225 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 RPL7L1P9-201ENST00000431298 745 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 LINC02257-202ENST00000433576 720 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 ST7-AS2-203ENST00000434993 918 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 AC009487.1-201ENST00000444164 403 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
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PDCD1Q15116 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 AC006967.1-201ENST00000467608 589 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 AC078785.3-201ENST00000476607 425 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
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PDCD1Q15116 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 AC084768.1-201ENST00000518926 923 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
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PDCD1Q15116 AC009597.1-201ENST00000521215 584 ntTSL 4 BASIC4.48□□□□□ -1.69
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PDCD1Q15116 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
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PDCD1Q15116 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 AKAP4-201ENST00000358526 2881 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 PSMD6-202ENST00000394431 1349 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 AL355306.2-205ENST00000635395 1646 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 OR10A3-202ENST00000642047 2650 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 OR52B1P-201ENST00000316506 909 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 AC005294.1-201ENST00000355509 281 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 SNORA58B-201ENST00000364259 136 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
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