Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SHPRHQ149N8 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SHPRHQ149N8 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SHPRHQ149N8 KMO-204ENST00000366559 5261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
SHPRHQ149N8 CSNK1G3-210ENST00000521364 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SHPRHQ149N8 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SHPRHQ149N8 MRRF-203ENST00000373723 1176 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SHPRHQ149N8 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SHPRHQ149N8 RPS20P25-201ENST00000412447 352 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SHPRHQ149N8 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SHPRHQ149N8 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SHPRHQ149N8 AL606490.7-201ENST00000433136 191 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SHPRHQ149N8 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SHPRHQ149N8 AC010157.1-201ENST00000440589 527 ntTSL 4 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SHPRHQ149N8 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SHPRHQ149N8 AL160262.1-201ENST00000522264 254 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SHPRHQ149N8 AP001317.1-201ENST00000531194 960 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SHPRHQ149N8 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SHPRHQ149N8 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
SHPRHQ149N8 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SHPRHQ149N8 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
SHPRHQ149N8 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
SHPRHQ149N8 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
SHPRHQ149N8 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
SHPRHQ149N8 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
SHPRHQ149N8 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
SHPRHQ149N8 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
SHPRHQ149N8 RPL23AP44-201ENST00000482216 473 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
SHPRHQ149N8 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
SHPRHQ149N8 AC025260.1-201ENST00000548858 430 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
SHPRHQ149N8 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
SHPRHQ149N8 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SHPRHQ149N8 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
SHPRHQ149N8 AP000695.2-201ENST00000428667 715 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SHPRHQ149N8 NREP-207ENST00000450761 636 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SHPRHQ149N8 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SHPRHQ149N8 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SHPRHQ149N8 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SHPRHQ149N8 NREP-AS1-202ENST00000507222 610 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SHPRHQ149N8 GOLGA5P1-201ENST00000507317 980 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SHPRHQ149N8 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SHPRHQ149N8 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SHPRHQ149N8 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SHPRHQ149N8 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SHPRHQ149N8 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SHPRHQ149N8 UQCRFS1P3-201ENST00000407697 385 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SHPRHQ149N8 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SHPRHQ149N8 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SHPRHQ149N8 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SHPRHQ149N8 MLIP-IT1-201ENST00000441845 643 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SHPRHQ149N8 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SHPRHQ149N8 AC002553.2-201ENST00000453217 340 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SHPRHQ149N8 AC068305.1-201ENST00000497406 726 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SHPRHQ149N8 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SHPRHQ149N8 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SHPRHQ149N8 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SHPRHQ149N8 AC007688.2-201ENST00000545158 369 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SHPRHQ149N8 AC074029.1-201ENST00000552531 1044 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SHPRHQ149N8 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SHPRHQ149N8 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SHPRHQ149N8 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
SHPRHQ149N8 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SHPRHQ149N8 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SHPRHQ149N8 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SHPRHQ149N8 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SHPRHQ149N8 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SHPRHQ149N8 PAFAH1B2-206ENST00000530272 850 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
SHPRHQ149N8 FBXO3-210ENST00000532057 918 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SHPRHQ149N8 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SHPRHQ149N8 AL162233.1-201ENST00000620014 944 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SHPRHQ149N8 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
SHPRHQ149N8 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SHPRHQ149N8 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
SHPRHQ149N8 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
SHPRHQ149N8 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SHPRHQ149N8 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
SHPRHQ149N8 SULT1E1-201ENST00000226444 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
SHPRHQ149N8 NRG4-201ENST00000394907 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
SHPRHQ149N8 AC048351.1-201ENST00000420064 602 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SHPRHQ149N8 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SHPRHQ149N8 RPL36AP33-201ENST00000450395 310 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SHPRHQ149N8 AL035409.1-201ENST00000454305 497 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SHPRHQ149N8 AC107015.1-201ENST00000466902 747 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SHPRHQ149N8 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SHPRHQ149N8 AP001001.1-202ENST00000527594 692 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SHPRHQ149N8 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SHPRHQ149N8 ZKSCAN7P1-201ENST00000543668 673 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SHPRHQ149N8 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SHPRHQ149N8 AL161896.1-201ENST00000597248 508 ntTSL 4 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SHPRHQ149N8 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SHPRHQ149N8 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
SHPRHQ149N8 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SHPRHQ149N8 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
SHPRHQ149N8 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SHPRHQ149N8 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SHPRHQ149N8 OR6C4-201ENST00000394256 1046 ntAPPRIS P1 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SHPRHQ149N8 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SHPRHQ149N8 KRR1-202ENST00000438169 975 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
SHPRHQ149N8 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
SHPRHQ149N8 CKS1BP1-201ENST00000555221 240 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
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