Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 MIR4435-2HG-206ENST00000432818 572 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 HCG2040054-201ENST00000435331 434 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 AP001432.1-201ENST00000440629 520 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 RPS7P5-201ENST00000441482 581 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 FABP3P2-201ENST00000453169 399 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 CFTRP1-201ENST00000456646 183 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 ZBTB8OS-205ENST00000465588 548 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 SCOC-205ENST00000502535 679 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 AC116535.2-201ENST00000532365 441 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 AP001360.2-201ENST00000534423 562 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 CBX3P5-201ENST00000552017 521 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 AC007686.2-201ENST00000554043 469 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 AC022968.1-201ENST00000567372 442 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 BNIP3P26-201ENST00000600827 554 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 AC083899.3-201ENST00000603413 594 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 AC103881.1-201ENST00000603476 538 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 AC024941.1-201ENST00000612250 334 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 AC013727.1-201ENST00000618581 839 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 BCLAF1-214ENST00000531224 7263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 PLCB4-206ENST00000414679 3947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 WNK3-202ENST00000375159 5403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 R3HDM1-220ENST00000628915 4325 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 AC106871.1-201ENST00000568324 3102 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 PDE1A-202ENST00000358139 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 PTP4A1-205ENST00000626021 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 GAB1-203ENST00000505913 2477 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 TAS2R9-201ENST00000240691 1075 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 PKIB-202ENST00000354275 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 SNORD74.4-201ENST00000364129 80 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 MIR525-201ENST00000384978 85 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 MIR1251-201ENST00000408552 70 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 RNU6-575P-201ENST00000411326 105 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 ST7-AS2-203ENST00000434993 918 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 RPS26P30-201ENST00000443431 335 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 HSFY6P-201ENST00000445573 403 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 AL356859.1-201ENST00000449180 414 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 AC106872.2-201ENST00000494303 480 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 AC093864.1-201ENST00000504555 745 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 WBP1LP4-201ENST00000505043 344 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 AC020593.1-201ENST00000507399 299 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 TEMN3-AS1-201ENST00000510211 401 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 AC027335.1-201ENST00000515377 543 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 AC027801.4-201ENST00000518420 395 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 AC023632.1-201ENST00000518463 375 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 NRG1-IT3-201ENST00000519023 505 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 AC007954.1-201ENST00000554198 494 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 AL355073.1-201ENST00000560296 517 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 AC124068.1-201ENST00000563131 678 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 GALP-203ENST00000590002 150 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 AP001542.2-201ENST00000593141 364 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 EIF1P6-201ENST00000600054 334 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 AL606834.2-201ENST00000602954 668 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 IL21-202ENST00000611104 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 CNOT10-206ENST00000454516 2760 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 LRRC77P-206ENST00000481578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 AC007529.1-201ENST00000418574 2178 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.5 ms