Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

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Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 AL590867.3-201ENST00000436953 438 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 NDUFS5P3-201ENST00000450668 321 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 LINC01075-201ENST00000455977 370 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 RN7SKP244-201ENST00000516513 307 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 AP001001.1-202ENST00000527594 692 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 DARS-AS1-221ENST00000608471 532 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 LSM5-206ENST00000409987 504 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 SNRPFP2-201ENST00000440710 251 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 AC021205.1-201ENST00000468797 348 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 AC008837.1-201ENST00000511513 412 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 C11orf65-206ENST00000529391 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 IL6ST-204ENST00000381293 612 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 RAP1BP1-201ENST00000412709 553 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 SEC63P1-201ENST00000425785 1258 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 RPS24P8-201ENST00000431490 402 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 RGS21-201ENST00000417209 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 LINC01625-201ENST00000454788 1690 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 OR52E6-201ENST00000329322 970 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 KRTAP27-1-201ENST00000382835 682 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 AC104454.1-201ENST00000421341 1401 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 MRPS33P4-201ENST00000434892 317 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 CCDC179-202ENST00000532798 791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 AC063948.1-201ENST00000547360 379 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 RLIMP2-201ENST00000427891 1563 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 TEX41-204ENST00000423031 491 ntTSL 4 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 AC092598.1-201ENST00000431708 797 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 AL353093.1-201ENST00000441292 436 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 AC104350.1-201ENST00000518750 877 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 AC084706.1-201ENST00000521879 558 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 AC079070.1-201ENST00000578740 555 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 SATB1-AS1-222ENST00000600177 751 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 AL513175.2-201ENST00000422071 443 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 AC092140.1-201ENST00000563090 549 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 RABGAP1L-203ENST00000347255 1744 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 HMGN1P5-201ENST00000448591 263 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 AC010406.1-201ENST00000507948 555 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 HIGD1AP10-201ENST00000527837 282 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 AC007688.2-201ENST00000545158 369 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 AC106745.1-201ENST00000566798 464 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
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