Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 AL122008.1-201ENST00000456078 452 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 RPL37P3-201ENST00000456825 293 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 RPS15AP1-201ENST00000457423 391 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 AC090142.1-201ENST00000465776 462 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 RN7SL441P-201ENST00000492388 296 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 EEF1A1P25-201ENST00000495704 1267 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 RPSAP51-201ENST00000497462 645 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 AC109464.3-201ENST00000509456 204 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 AC015795.1-201ENST00000513669 327 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 AC005740.3-201ENST00000520882 344 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 PHBP17-201ENST00000528576 541 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 AP000442.2-202ENST00000531311 601 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 AC091053.2-201ENST00000534169 537 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 AC084783.1-201ENST00000565846 910 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 AC011824.2-203ENST00000579975 633 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 KIAA1524-208ENST00000625495 147 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 LINC00622-201ENST00000562811 1570 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 CYP2C8-210ENST00000535898 1799 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 HACD3-209ENST00000566511 1782 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 NMD3P1-201ENST00000439704 1488 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 AC010300.1-201ENST00000600671 5134 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 USP45-204ENST00000369233 2514 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 DNM3OS-201ENST00000417354 4358 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 ACTR3BP2-202ENST00000623630 1338 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 TCEAL7-202ENST00000372666 852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 Z85994.1-201ENST00000406912 606 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 AL591848.1-201ENST00000413092 322 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 SNRPFP1-201ENST00000414761 252 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 LINC01341-201ENST00000419361 552 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 AC010235.1-201ENST00000450613 547 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 BX842559.2-201ENST00000451418 605 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 CYCSP34-201ENST00000458172 304 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 AC022034.3-201ENST00000471393 478 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 RNU6-202P-201ENST00000515998 96 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 LINC02365-202ENST00000520280 607 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 AC136424.2-201ENST00000522582 563 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 AP000786.1-201ENST00000541092 581 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 AL049779.1-201ENST00000553306 670 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 AC009562.1-202ENST00000558755 565 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 AC017100.2-201ENST00000584628 355 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 AC105094.1-201ENST00000588245 316 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 AC008782.1-201ENST00000603386 430 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 AL049794.2-201ENST00000616301 365 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 AC004076.2-201ENST00000620532 3323 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
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