Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 LAMTOR5-AS1-244ENST00000629484 780 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 CYP4F35P-202ENST00000636121 390 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 OR8S1-202ENST00000641651 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 HNMT-202ENST00000280097 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 LINC01109-201ENST00000603837 3081 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 KANSL1L-209ENST00000457374 2264 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 TRIM36-209ENST00000514154 1952 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 LZTFL1-216ENST00000539217 4113 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 KYNU-202ENST00000375773 1772 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 ASB14-202ENST00000487349 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 RPL7P60-201ENST00000397636 735 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 AL592291.1-201ENST00000403830 352 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 RN7SKP235-201ENST00000410662 305 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 AC069218.2-201ENST00000411665 344 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 AC073136.2-201ENST00000417282 849 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 CYCSP10-201ENST00000417973 294 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 CYCSP12-201ENST00000437729 300 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 ZBTB40-IT1-201ENST00000438551 273 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 AC243772.1-201ENST00000451620 410 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 AL121877.1-201ENST00000453704 622 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 AL359265.3-201ENST00000456125 579 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 AL136126.1-201ENST00000473603 402 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 NDUFB2-213ENST00000476470 482 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 RN7SL441P-201ENST00000492388 296 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 AC112198.3-201ENST00000505950 441 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 RNU6-941P-201ENST00000516346 108 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 AC005740.3-201ENST00000520882 344 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 AC132219.1-201ENST00000524337 478 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 AC006206.2-202ENST00000537714 648 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 AC055720.2-201ENST00000537724 172 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 LINC01479-201ENST00000545520 509 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 LINC02185-201ENST00000575424 760 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 AC006504.2-201ENST00000589471 458 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 AC074101.1-201ENST00000637861 241 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 AL359922.3-201ENST00000624779 1670 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 BCLAF1P2-201ENST00000624956 2609 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 DNAH8-205ENST00000449981 12940 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 STAP1-201ENST00000265404 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 RIOK3P1-201ENST00000418778 1528 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 PIGN-242ENST00000640145 4505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
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