Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 AC090971.4-201ENST00000560291 1800 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 MAP9-208ENST00000515654 2044 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 ALS2CR12-201ENST00000286190 1769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 OR5AN1-201ENST00000313940 1037 ntAPPRIS P1 BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 C1orf100-202ENST00000366537 483 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 AP000534.2-201ENST00000412729 568 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 AC008060.2-201ENST00000415333 468 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 TXNDC12-AS1-201ENST00000428794 391 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 CFL1P1-202ENST00000432948 411 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 RPL39L-202ENST00000433055 749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 AL353597.2-202ENST00000434901 373 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 AL031663.1-201ENST00000437445 219 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 CYCSP12-201ENST00000437729 300 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 AL133260.2-201ENST00000445833 396 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 LINC01422-203ENST00000447149 509 ntTSL 4 BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 HMGB1P4-201ENST00000455362 567 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 AC034195.1-203ENST00000455703 728 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 CSN1S1-203ENST00000507763 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 MYLK-AS2-201ENST00000510827 500 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 AC108471.1-201ENST00000513977 287 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 RPL26L1-203ENST00000519239 679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 AC079209.1-202ENST00000521953 522 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
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FOXE3Q13461 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
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FOXE3Q13461 AC000068.2-201ENST00000608816 460 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
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FOXE3Q13461 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
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FOXE3Q13461 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 AP000756.2-201ENST00000624168 2567 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 AL451142.2-201ENST00000429076 2090 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 AC010329.2-201ENST00000595195 2737 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 ELF1-204ENST00000625359 2032 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.73
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