Protein–RNA interactions for Protein: Q13424

SNTA1, Alpha-1-syntrophin, humanhuman

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTA1Q13424 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SNTA1Q13424 ARF4P1-201ENST00000605447 541 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SNTA1Q13424 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SNTA1Q13424 AC023043.4-201ENST00000612081 449 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SNTA1Q13424 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SNTA1Q13424 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SNTA1Q13424 TFG-209ENST00000615993 1244 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
SNTA1Q13424 OR10A6-202ENST00000623991 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SNTA1Q13424 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SNTA1Q13424 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SNTA1Q13424 AC008013.2-202ENST00000637965 364 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SNTA1Q13424 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SNTA1Q13424 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
SNTA1Q13424 MTCO1P14-201ENST00000441695 1559 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SNTA1Q13424 ALCAM-207ENST00000486979 1818 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SNTA1Q13424 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SNTA1Q13424 MGA-207ENST00000566586 14439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
SNTA1Q13424 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SNTA1Q13424 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
SNTA1Q13424 ETV1-202ENST00000399357 6096 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SNTA1Q13424 OR4A15-201ENST00000314706 1035 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SNTA1Q13424 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SNTA1Q13424 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SNTA1Q13424 CD80-202ENST00000383669 771 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
SNTA1Q13424 RNU6-1122P-201ENST00000384449 107 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SNTA1Q13424 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SNTA1Q13424 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SNTA1Q13424 AL354766.2-201ENST00000414085 423 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SNTA1Q13424 AC098484.2-201ENST00000414339 601 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
SNTA1Q13424 RPS23P10-201ENST00000416185 486 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SNTA1Q13424 AC097717.1-228ENST00000417006 754 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SNTA1Q13424 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SNTA1Q13424 AC105399.1-201ENST00000422418 418 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SNTA1Q13424 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SNTA1Q13424 AC092839.2-201ENST00000431130 377 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SNTA1Q13424 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SNTA1Q13424 DIAPH2-AS1-201ENST00000439759 971 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SNTA1Q13424 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SNTA1Q13424 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SNTA1Q13424 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SNTA1Q13424 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SNTA1Q13424 LMOD2-201ENST00000456238 918 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
SNTA1Q13424 RPS29P19-201ENST00000479709 171 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SNTA1Q13424 AC111000.4-201ENST00000504301 569 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SNTA1Q13424 LINC02496-201ENST00000509559 584 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SNTA1Q13424 AC004704.1-201ENST00000511219 583 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
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SNTA1Q13424 MIR6798-201ENST00000612887 67 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
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SNTA1Q13424 CT45A10-202ENST00000617981 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
SNTA1Q13424 AC244196.2-201ENST00000621184 411 ntAPPRIS P1 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SNTA1Q13424 MIR7702-201ENST00000621931 59 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
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SNTA1Q13424 ZNF678-202ENST00000397097 8212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
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SNTA1Q13424 DST-201ENST00000244364 16742 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
SNTA1Q13424 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
SNTA1Q13424 UBE2D2-201ENST00000253815 444 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
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SNTA1Q13424 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SNTA1Q13424 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
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SNTA1Q13424 RN7SKP56-201ENST00000410513 331 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SNTA1Q13424 RN7SKP177-201ENST00000410567 355 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
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SNTA1Q13424 AL391807.1-202ENST00000419979 534 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
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SNTA1Q13424 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SNTA1Q13424 NIPA2P1-201ENST00000426223 976 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SNTA1Q13424 COX6CP15-201ENST00000426313 211 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SNTA1Q13424 COX6B1P7-201ENST00000430845 235 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SNTA1Q13424 PRELID3BP10-201ENST00000431957 584 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SNTA1Q13424 RPL37P1-201ENST00000432310 284 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SNTA1Q13424 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SNTA1Q13424 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
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