Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 KCNU1-201ENST00000399881 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SP140Q13342 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SP140Q13342 FBXO8-205ENST00000615392 1591 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SP140Q13342 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SP140Q13342 STON1-GTF2A1L-201ENST00000394751 3534 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
SP140Q13342 RASA1-203ENST00000506290 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SP140Q13342 PNPLA8-204ENST00000426128 4268 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SP140Q13342 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
SP140Q13342 RBBP6-202ENST00000348022 5739 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
SP140Q13342 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SP140Q13342 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SP140Q13342 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SP140Q13342 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AL603766.1-201ENST00000407763 664 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SP140Q13342 RNA5SP239-201ENST00000410218 129 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AC118345.1-201ENST00000411785 366 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AL589642.2-201ENST00000413291 839 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SP140Q13342 DYDC1-203ENST00000421924 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
SP140Q13342 LINC01074-201ENST00000422527 555 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AC104837.2-201ENST00000427236 424 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SP140Q13342 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SP140Q13342 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AC004875.1-201ENST00000432702 378 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SP140Q13342 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AL356276.2-201ENST00000435919 558 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SP140Q13342 ZBTB40-IT1-201ENST00000438551 273 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SP140Q13342 H2AFZP5-201ENST00000446960 382 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AC079168.2-201ENST00000453977 416 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AC108751.2-201ENST00000469993 231 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SP140Q13342 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SP140Q13342 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AC113346.1-201ENST00000510150 287 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AP001574.1-201ENST00000519566 546 ntTSL 4 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AP001922.4-201ENST00000526967 290 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AC009652.2-201ENST00000527978 516 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AC022081.1-201ENST00000537327 433 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AL132712.2-201ENST00000556653 127 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AC093227.3-202ENST00000586606 704 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SP140Q13342 SLC14A2-AS1-203ENST00000592286 528 ntTSL 4 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AC008782.1-201ENST00000603386 430 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SP140Q13342 MIR6719-201ENST00000622428 87 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AC091905.1-201ENST00000624400 311 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SP140Q13342 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AC008505.1-205ENST00000637847 703 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SP140Q13342 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SP140Q13342 ZNF28-203ENST00000438150 5171 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SP140Q13342 KMO-204ENST00000366559 5261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AL122126.1-201ENST00000546905 1318 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AC131971.1-201ENST00000332881 1482 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SP140Q13342 MTRNR2L7-201ENST00000544824 1535 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SP140Q13342 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SP140Q13342 ERCC6-202ENST00000374127 1782 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SP140Q13342 LINC00283-201ENST00000430111 1947 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AC092329.3-201ENST00000611392 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SP140Q13342 KLHL13-208ENST00000541812 3102 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SP140Q13342 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SP140Q13342 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SP140Q13342 CKS1B-201ENST00000308987 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SP140Q13342 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SP140Q13342 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SP140Q13342 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
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SP140Q13342 LINC01362-201ENST00000419658 338 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
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SP140Q13342 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AC008278.2-201ENST00000438178 409 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SP140Q13342 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SP140Q13342 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SP140Q13342 RPL7AP28-201ENST00000464513 571 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AC063943.1-201ENST00000465434 453 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AC011005.3-201ENST00000491624 395 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SP140Q13342 NDUFB5P1-201ENST00000508134 564 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SP140Q13342 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SP140Q13342 LINC02313-201ENST00000553330 550 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SP140Q13342 ALDH3A2-208ENST00000571163 590 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
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