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| PTK7 | Q13308 | AL357559.1-201 | ENST00000622228 | 274 nt | BASIC | 6.1 | □□□□□ -1.43 | | |
| PTK7 | Q13308 | NBPF20-205 | ENST00000622803 | 3689 nt | TSL 5 BASIC | 6.1 | □□□□□ -1.43 | | |
| PTK7 | Q13308 | ARHGAP20-206 | ENST00000533353 | 6066 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 6.1 | □□□□□ -1.43 | | |
| PTK7 | Q13308 | HERC4-205 | ENST00000412272 | 4211 nt | TSL 1 (best) BASIC | 6.1 | □□□□□ -1.43 | | |
| PTK7 | Q13308 | ZNF658-201 | ENST00000612867 | 4160 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 6.1 | □□□□□ -1.43 | | |
| PTK7 | Q13308 | RABGAP1L-208 | ENST00000392064 | 6282 nt | TSL 1 (best) BASIC | 6.1 | □□□□□ -1.43 | | |
| PTK7 | Q13308 | ACSL5-204 | ENST00000393081 | 3380 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 6.1 | □□□□□ -1.43 | | |
| PTK7 | Q13308 | AC004982.1-201 | ENST00000608770 | 1655 nt | TSL 4 BASIC | 6.1 | □□□□□ -1.43 | | |
| PTK7 | Q13308 | CCR2-202 | ENST00000400888 | 2232 nt | TSL 1 (best) BASIC | 6.1 | □□□□□ -1.43 | | |
| PTK7 | Q13308 | ARHGEF12-213 | ENST00000532993 | 8753 nt | TSL 1 (best) BASIC | 6.1 | □□□□□ -1.43 | | |
| PTK7 | Q13308 | ZFAND6-212 | ENST00000559775 | 1602 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 6.1 | □□□□□ -1.43 | | |
| PTK7 | Q13308 | OR6C2-202 | ENST00000641202 | 2105 nt | APPRIS P1 BASIC | 6.1 | □□□□□ -1.43 | | |
| PTK7 | Q13308 | C1orf141-202 | ENST00000371006 | 2053 nt | APPRIS P3 TSL 2 BASIC | 6.1 | □□□□□ -1.43 | | |
| PTK7 | Q13308 | SV2B-201 | ENST00000330276 | 11202 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 6.1 | □□□□□ -1.43 | | |
| PTK7 | Q13308 | EIF3H-209 | ENST00000521861 | 3959 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 6.09 | □□□□□ -1.43 | | |
| PTK7 | Q13308 | PSD3-204 | ENST00000440756 | 11690 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 6.09 | □□□□□ -1.43 | | |
| PTK7 | Q13308 | TIPARP-205 | ENST00000486483 | 2150 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 6.09 | □□□□□ -1.43 | | |
| PTK7 | Q13308 | AASDH-210 | ENST00000602986 | 3480 nt | TSL 5 BASIC | 6.09 | □□□□□ -1.43 | | |
| PTK7 | Q13308 | KSR2-201 | ENST00000339824 | 17726 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 6.09 | □□□□□ -1.43 | | |
| PTK7 | Q13308 | C9orf153-204 | ENST00000613665 | 1738 nt | APPRIS P2 TSL 2 BASIC | 6.09 | □□□□□ -1.43 | | |
| PTK7 | Q13308 | RNA5SP443-201 | ENST00000363083 | 132 nt | BASIC | 6.09 | □□□□□ -1.43 | | |
| PTK7 | Q13308 | RNU6-61P-201 | ENST00000365528 | 109 nt | BASIC | 6.09 | □□□□□ -1.43 | | |
| PTK7 | Q13308 | Y_RNA.576-201 | ENST00000384781 | 102 nt | BASIC | 6.09 | □□□□□ -1.43 | | |
| PTK7 | Q13308 | MIR585-201 | ENST00000384887 | 94 nt | BASIC | 6.09 | □□□□□ -1.43 | | |
| PTK7 | Q13308 | RNU11-201 | ENST00000387069 | 134 nt | BASIC | 6.09 | □□□□□ -1.43 | | |
| PTK7 | Q13308 | MIR550A3-201 | ENST00000390735 | 95 nt | BASIC | 6.09 | □□□□□ -1.43 | | |
| PTK7 | Q13308 | RNU6-754P-201 | ENST00000391166 | 107 nt | BASIC | 6.09 | □□□□□ -1.43 | | |