Protein–RNA interactions for Protein: Q13107

USP4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP4Q13107 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
USP4Q13107 RPS17P15-201ENST00000475609 349 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
USP4Q13107 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
USP4Q13107 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
USP4Q13107 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
USP4Q13107 AC110275.1-201ENST00000534420 623 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.1□□□□□ -1.43
USP4Q13107 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
USP4Q13107 NQO1-206ENST00000564043 892 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
USP4Q13107 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
USP4Q13107 MIR3176-201ENST00000582210 90 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
USP4Q13107 TEX26-AS1-204ENST00000585582 853 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
USP4Q13107 ZNF561-AS1-207ENST00000591932 676 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
USP4Q13107 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
USP4Q13107 RN7SL544P-201ENST00000617232 284 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
USP4Q13107 RN7SL763P-201ENST00000620922 284 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
USP4Q13107 USP45-204ENST00000369233 2514 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
USP4Q13107 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
USP4Q13107 BCL2L14-213ENST00000589718 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
USP4Q13107 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
USP4Q13107 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
USP4Q13107 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
USP4Q13107 LINC01277-201ENST00000419957 2398 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
USP4Q13107 MCM3AP-AS1-204ENST00000432735 2302 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
USP4Q13107 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
USP4Q13107 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
USP4Q13107 CDK14-206ENST00000436577 4787 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
USP4Q13107 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
USP4Q13107 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
USP4Q13107 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
USP4Q13107 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
USP4Q13107 DLG1-210ENST00000422288 2854 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
USP4Q13107 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
USP4Q13107 TPK1-207ENST00000538212 2243 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
USP4Q13107 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
USP4Q13107 SLFN12L-205ENST00000628453 1767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
USP4Q13107 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
USP4Q13107 ZNF480-205ENST00000595962 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
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USP4Q13107 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
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USP4Q13107 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
USP4Q13107 ADGB-205ENST00000397944 5325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
USP4Q13107 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.44
USP4Q13107 Z95327.2-201ENST00000414579 1873 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
USP4Q13107 PUS10-203ENST00000407787 1820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.44
USP4Q13107 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
USP4Q13107 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
USP4Q13107 SELENOI-205ENST00000613142 8126 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
USP4Q13107 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
USP4Q13107 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
USP4Q13107 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
USP4Q13107 FP236241.1-201ENST00000623374 7632 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
USP4Q13107 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
USP4Q13107 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
USP4Q13107 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
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