Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 AC104307.1-201ENST00000616142 196 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
IFT88Q13099 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
IFT88Q13099 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC3.32□□□□□ -1.88
IFT88Q13099 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
IFT88Q13099 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC3.31□□□□□ -1.88
IFT88Q13099 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
IFT88Q13099 RNU6-761P-201ENST00000384148 107 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
IFT88Q13099 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
IFT88Q13099 REV3L-IT1-201ENST00000411895 382 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
IFT88Q13099 IFNAR2-206ENST00000413881 710 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
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IFT88Q13099 RSL24D1P8-201ENST00000434442 492 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
IFT88Q13099 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
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IFT88Q13099 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
IFT88Q13099 RPL7P15-201ENST00000461190 712 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
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IFT88Q13099 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
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IFT88Q13099 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
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IFT88Q13099 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
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IFT88Q13099 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
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IFT88Q13099 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
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IFT88Q13099 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
IFT88Q13099 POMP-202ENST00000460403 1428 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
IFT88Q13099 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
IFT88Q13099 OR6C2-201ENST00000322678 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
IFT88Q13099 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
IFT88Q13099 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
IFT88Q13099 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
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