Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 PARP8-211ENST00000505554 3825 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 WDR49-207ENST00000479765 2108 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 PDE1A-202ENST00000358139 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 MTCO1P14-201ENST00000441695 1559 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 ELL2P4-201ENST00000446870 1376 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 AP000526.1-201ENST00000603308 1388 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 TEX41-202ENST00000414256 604 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 AL022400.1-201ENST00000423946 935 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 AC234781.2-201ENST00000426370 994 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 NPM1P34-201ENST00000428821 893 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 ST7-AS2-203ENST00000434993 918 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 UBE2D3P1-201ENST00000436669 444 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 NAP1L1P1-201ENST00000524793 1063 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 SPAG11B-207ENST00000528168 481 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 AC022367.1-202ENST00000535066 537 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 AL049779.1-201ENST00000553306 670 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 CFL2-206ENST00000556161 546 ntTSL 4 BASIC4.2□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 AC138207.5-201ENST00000579561 409 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 LINC01255-206ENST00000591431 441 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 AC004987.4-201ENST00000603383 338 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 AC010680.3-201ENST00000604215 520 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 AC244205.2-202ENST00000635781 342 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 AL773545.4-201ENST00000637262 310 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 FAM157B-203ENST00000639350 358 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 AL513478.4-201ENST00000641636 310 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 POU2F1-204ENST00000367866 13905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 OTUD4P1-201ENST00000237841 3067 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 DDX60L-201ENST00000260184 6754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 AL033397.1-201ENST00000502390 3653 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 EFHC1-205ENST00000538167 5308 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 TAS2R19-201ENST00000390673 1002 ntAPPRIS P1 BASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 MIR1284-201ENST00000408337 120 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 FRMPD3-AS1-201ENST00000415252 457 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 TRBV24OR9-2-201ENST00000416632 435 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 AL593851.1-201ENST00000426171 157 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 TXNL1P1-201ENST00000429528 554 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 AL451129.1-201ENST00000437471 285 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 RANP8-201ENST00000444720 713 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 VPS29-202ENST00000447578 996 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 RN7SL93P-201ENST00000463035 293 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 BET1P1-201ENST00000482276 359 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 NCOR1P1-202ENST00000486162 291 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 AC147055.4-201ENST00000504399 745 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 BTF3L4P4-201ENST00000506381 449 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 AC106895.1-201ENST00000515825 548 ntTSL 4 BASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 CARD18-201ENST00000526823 627 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 AL512347.1-201ENST00000566420 503 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
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