Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 AC009505.1-201ENST00000413151 424 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 AC234782.4-201ENST00000417646 1048 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 ENOX1-AS2-201ENST00000434273 609 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 LINC00411-201ENST00000436722 461 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 ELOCP13-201ENST00000443934 329 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 LINC02053-202ENST00000488262 940 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 AC093722.1-201ENST00000504882 489 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 EIF4E-208ENST00000505992 898 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 LINC02283-201ENST00000511634 474 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 LY96-202ENST00000518893 430 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 AP002812.3-201ENST00000527012 551 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 OR4C2P-201ENST00000530855 1064 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 AC135001.1-201ENST00000544546 283 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 MTND1P24-201ENST00000552175 861 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 MTND4P33-201ENST00000556706 766 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 AGGF1P8-201ENST00000562979 1000 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 AC097467.3-207ENST00000602249 725 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 AC091057.2-201ENST00000602594 792 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 AL353811.1-201ENST00000602851 736 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 AC123768.3-201ENST00000613733 523 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 ADGRL2-207ENST00000370723 5254 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 ADGRL2-208ENST00000370725 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC2.95□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 RNU6-353P-201ENST00000364266 108 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 AL136116.1-201ENST00000403591 381 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 MTCO3P31-201ENST00000405526 789 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 AC023469.2-201ENST00000425983 657 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 Z93242.1-201ENST00000427102 353 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 AC010890.1-202ENST00000432414 535 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
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GTF3C1Q12789 AL391704.1-202ENST00000453889 874 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
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GTF3C1Q12789 Z98949.1-212ENST00000609820 837 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
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GTF3C1Q12789 KRTAP22-2-201ENST00000382830 293 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
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GTF3C1Q12789 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 BX248409.1-201ENST00000455497 255 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
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GTF3C1Q12789 AC008780.2-201ENST00000509844 820 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
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GTF3C1Q12789 ARL2BPP6-201ENST00000512757 439 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 LINC02492-204ENST00000515660 584 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 COX6B1P6-201ENST00000522347 255 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 AL445363.2-202ENST00000555361 435 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 AL442163.1-201ENST00000557251 515 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
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