Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 AL049794.2-201ENST00000616301 365 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AC099494.2-201ENST00000623371 978 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 VNN2-201ENST00000326499 2118 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 OR6K3-201ENST00000368145 1844 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 ANKRD30A-201ENST00000361713 4405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 DEFB128-201ENST00000334391 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 RN7SKP206-201ENST00000410823 293 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 RN7SKP247-201ENST00000411094 308 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 AL353693.1-201ENST00000429567 442 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 ARL2BPP10-201ENST00000446487 531 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 LINC01422-203ENST00000447149 509 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 RPL21P6-201ENST00000479171 504 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 RN7SL273P-201ENST00000481561 299 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 RN7SL101P-201ENST00000496350 279 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 RN7SKP99-201ENST00000517028 307 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 MS4A7-208ENST00000530234 730 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 AC022404.1-201ENST00000555320 273 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 AC010547.6-201ENST00000571789 193 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 MIR4505-201ENST00000582238 73 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 AC067968.2-201ENST00000592583 566 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 TEX41-238ENST00000604253 709 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 AC244107.2-201ENST00000611773 76 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 AC132068.1-201ENST00000623805 459 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 CU639417.4-201ENST00000623928 207 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 LINC00976-202ENST00000628064 534 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 C2orf83-206ENST00000642055 453 ntAPPRIS P3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 AC091046.3-201ENST00000631455 1574 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 ELL2P4-201ENST00000446870 1376 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 KCNRG-201ENST00000312942 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 AC000123.3-201ENST00000624029 4975 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 C6orf10-210ENST00000617061 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 CD86-204ENST00000469710 1604 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 OFD1P9Y-201ENST00000417699 1491 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 DBIP1-201ENST00000401435 260 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 AL136368.1-201ENST00000416249 401 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 AC093581.1-202ENST00000430890 391 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 AL136140.1-201ENST00000436113 473 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 PLGLA-201ENST00000465668 449 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 AC092754.1-201ENST00000472975 479 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 AL049874.2-201ENST00000492636 288 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 AC105914.2-201ENST00000507525 233 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 WWC2-AS1-201ENST00000511846 404 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 RNA5SP92-201ENST00000516437 110 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 AC099520.1-208ENST00000518276 472 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 AC018442.3-201ENST00000523025 183 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 MOCS2-208ENST00000527216 707 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 AC026992.1-201ENST00000558269 571 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 LINC02157-201ENST00000558885 447 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.1 ms