Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 AC007014.1-201ENST00000572828 610 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 AP004372.1-201ENST00000604842 844 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 KLRC2-206ENST00000619500 883 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 RPS6KA6-204ENST00000620340 8169 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 AL353743.4-201ENST00000422653 1547 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 AL512646.1-201ENST00000269395 1077 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 DEFB106A-201ENST00000335186 303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 AL355306.2-209ENST00000437803 357 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 AC012625.1-201ENST00000515153 625 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 AC008507.1-201ENST00000587506 734 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 STARD13-AS-208ENST00000589472 859 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 AL031985.3-201ENST00000565390 2449 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 ATP2B1-202ENST00000359142 6977 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 NLGN1-201ENST00000361589 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 LAP3P1-201ENST00000403648 294 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 AC016933.1-201ENST00000504735 539 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 AC093772.1-201ENST00000513519 506 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 ING3-205ENST00000445699 1723 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 ZFAND6-223ENST00000616533 1653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 AC025125.1-201ENST00000624743 1922 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 OR51F1-201ENST00000380383 960 ntAPPRIS P5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 MIR137-201ENST00000385223 102 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 RPS12P23-201ENST00000419579 400 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 AC011405.1-202ENST00000504658 803 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 LINC01378-202ENST00000437514 783 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 AP000936.3-201ENST00000438127 255 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 FGF7P3-201ENST00000454645 303 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 AC105918.1-201ENST00000474399 838 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 ZRANB2-AS2-221ENST00000624050 629 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 FER-202ENST00000438717 1531 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 YWHAZ-219ENST00000522542 1394 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 TTC39DP-201ENST00000416781 1688 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 AC107027.3-201ENST00000565095 3473 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 BPIFC-202ENST00000397450 458 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 AL158825.1-201ENST00000414735 521 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 AC026320.1-202ENST00000444729 672 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 AC093422.2-201ENST00000452599 686 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 AC103968.1-201ENST00000557841 573 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 RNU2-17P-201ENST00000410290 190 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 AC002378.1-201ENST00000432360 298 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 MIR423-201ENST00000362201 94 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 SUMO1-205ENST00000409205 534 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 MTATP6P11-201ENST00000428071 670 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 AC016687.1-201ENST00000482574 353 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 LINC00560-201ENST00000564593 1599 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms