Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 AC069304.2-201ENST00000605154 435 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PGGT1BP53609 AC010857.1-201ENST00000606398 594 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PGGT1BP53609 AC233309.1-201ENST00000619522 751 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PGGT1BP53609 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PGGT1BP53609 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PGGT1BP53609 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PGGT1BP53609 SLC2A3P1-201ENST00000519666 1451 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PGGT1BP53609 AC010186.3-201ENST00000537616 2508 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
PGGT1BP53609 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PGGT1BP53609 RABGAP1L-202ENST00000325589 1880 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
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PGGT1BP53609 PIGW-206ENST00000620233 2264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
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PGGT1BP53609 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PGGT1BP53609 FKTN-201ENST00000223528 7364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
PGGT1BP53609 DST-201ENST00000244364 16742 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
PGGT1BP53609 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
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PGGT1BP53609 RAPGEF6-201ENST00000296859 5618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
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PGGT1BP53609 MRPL42-206ENST00000549982 15582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
PGGT1BP53609 C12orf45-204ENST00000552951 23529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
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PGGT1BP53609 AC092650.1-201ENST00000447571 1808 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
PGGT1BP53609 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
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PGGT1BP53609 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
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PGGT1BP53609 AKAP4-201ENST00000358526 2881 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
PGGT1BP53609 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
PGGT1BP53609 LCA5L-201ENST00000288350 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
PGGT1BP53609 AC010300.1-201ENST00000600671 5134 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PGGT1BP53609 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PGGT1BP53609 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PGGT1BP53609 CARD6-202ENST00000381677 1094 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
PGGT1BP53609 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PGGT1BP53609 AC025750.1-201ENST00000399891 379 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PGGT1BP53609 AGR3-202ENST00000402239 563 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
PGGT1BP53609 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
PGGT1BP53609 RN7SKP56-201ENST00000410513 331 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PGGT1BP53609 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
PGGT1BP53609 HMGB3P23-201ENST00000414981 585 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PGGT1BP53609 AC093159.1-201ENST00000416845 424 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
PGGT1BP53609 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PGGT1BP53609 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PGGT1BP53609 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PGGT1BP53609 HRH4-202ENST00000426880 909 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
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