Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 AKAP7-208ENST00000537868 1006 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
PTPRBP23467 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTPRBP23467 AL136298.1-202ENST00000556520 518 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
PTPRBP23467 AL353708.2-201ENST00000567486 447 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
PTPRBP23467 SATB1-AS1-226ENST00000625515 776 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
PTPRBP23467 SATB1-AS1-259ENST00000629477 853 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
PTPRBP23467 AL359715.4-201ENST00000606629 1436 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTPRBP23467 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
PTPRBP23467 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
PTPRBP23467 AKT3-201ENST00000263826 7081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
PTPRBP23467 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
PTPRBP23467 OFD1P6Y-201ENST00000432335 1637 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
PTPRBP23467 TTTY9B-201ENST00000433794 1637 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
PTPRBP23467 LINC02493-201ENST00000509964 1704 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
PTPRBP23467 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTPRBP23467 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTPRBP23467 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
PTPRBP23467 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
PTPRBP23467 RPL23AP4-201ENST00000427757 463 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTPRBP23467 ELOCP6-201ENST00000429066 328 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTPRBP23467 GNGT1-204ENST00000430875 628 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
PTPRBP23467 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTPRBP23467 BIRC6-AS1-201ENST00000455572 697 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
PTPRBP23467 ELOCP12-201ENST00000458706 328 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTPRBP23467 AC126121.1-201ENST00000482313 553 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTPRBP23467 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTPRBP23467 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
PTPRBP23467 AC008565.1-201ENST00000509046 885 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTPRBP23467 AC010280.3-201ENST00000515504 587 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
PTPRBP23467 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTPRBP23467 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
PTPRBP23467 AC022616.2-201ENST00000523185 300 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTPRBP23467 AF117829.1-209ENST00000523995 767 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
PTPRBP23467 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
PTPRBP23467 TIMM9-209ENST00000556367 572 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
PTPRBP23467 AC091488.1-201ENST00000604239 660 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTPRBP23467 LINC02098-202ENST00000609260 554 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
PTPRBP23467 CGA-204ENST00000627148 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
PTPRBP23467 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
PTPRBP23467 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
PTPRBP23467 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
PTPRBP23467 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
PTPRBP23467 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
PTPRBP23467 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
PTPRBP23467 LSM5-206ENST00000409987 504 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
PTPRBP23467 RPL26P37-201ENST00000411983 438 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPRBP23467 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPRBP23467 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
PTPRBP23467 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
PTPRBP23467 LINC02345-201ENST00000557883 766 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
PTPRBP23467 AC115989.2-201ENST00000578640 563 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPRBP23467 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPRBP23467 MIR7973-1-201ENST00000614683 76 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPRBP23467 AL355493.4-201ENST00000618530 292 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPRBP23467 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
PTPRBP23467 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
PTPRBP23467 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
PTPRBP23467 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
PTPRBP23467 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRBP23467 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
PTPRBP23467 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC2.56□□□□□ -2
PTPRBP23467 RNU6-819P-201ENST00000364116 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRBP23467 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRBP23467 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC2.56□□□□□ -2
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PTPRBP23467 OR2B8P-201ENST00000432841 938 ntBASIC2.56□□□□□ -2
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PTPRBP23467 AC092754.2-201ENST00000463506 460 ntBASIC2.56□□□□□ -2
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PTPRBP23467 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRBP23467 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
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PTPRBP23467 OR6C73P-201ENST00000546432 358 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRBP23467 AC106745.1-201ENST00000566798 464 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
PTPRBP23467 MTND4LP24-201ENST00000572277 291 ntBASIC2.56□□□□□ -2
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PTPRBP23467 AC008703.1-201ENST00000637629 1174 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
PTPRBP23467 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PTPRBP23467 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PTPRBP23467 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PTPRBP23467 EIF1AY-202ENST00000382772 746 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PTPRBP23467 RNU6-317P-201ENST00000384031 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRBP23467 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
PTPRBP23467 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRBP23467 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRBP23467 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
PTPRBP23467 PCNAP1-201ENST00000505363 709 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRBP23467 AC084706.1-201ENST00000521879 558 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
PTPRBP23467 OR5AK3P-201ENST00000527486 1297 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRBP23467 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
PTPRBP23467 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
PTPRBP23467 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
PTPRBP23467 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
PTPRBP23467 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRBP23467 DGKH-201ENST00000261491 17261 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PTPRBP23467 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
PTPRBP23467 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
PTPRBP23467 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
PTPRBP23467 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
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